随着时间的推移，分子标记已被证明是快速和可靠的真菌种群分类。这里确定了五种菌草平菇（平菇p969，红平菇， pl-30，黄平菇， P. G）的基因组多样性，使用ITS和RAPD进行表征。使用PCR扩增rDNA的ITS区，所有菌株的ITS的大小分别在680bp至1300bp之间。ITS条带在所有菌株中都是多态性的。基于ITS区域的系统发育树表明所选择的菌株可以分为三个簇。在14个随机扩增多态性DNA（RAPD）引物中，使用的DTT10和DTT11具有良好的多态性和稳定的带型;但是DTT-9的多态性条带在pl-30不完全可见。　　本研究使用基于频率相似性的簇分析，物种之间的亲缘关系从50％到95％，簇A的三个物种（黄平菇， P. G和PL-30）之间的相似性为80％至95％，簇B由两个物种（平菇P969和红平菇）组成，相似性为65％。相似性矩阵表明，亲缘关系最近的物种是黄平菇和pl-30，其具有95％的同源性。研究表明使用菌草培养平菇五菌株的有效性和确定最有效的公式，禾本科草（1） purpurum巨菌草），2） Dicranoteris dichotoma（象），3）莱索托，4）zizantiodes香根草，5） Mischantum Floridulus，调查了他们的的生长和产量的参数。结果表明，平菇”p969”表现出最高的生物产量和效率比所有的公式，其他菌株，菌丝体的运行速度和数量均高于平菇子实体中的“p969”和红平菇“红色”比其他三株。蘑菇菌株的质量几乎相同。我们的研究表明，菌草技术可以用来作为一种新型的、实用的、和杏鲍菇栽培容易接近的替代物，这也证明了有效利用其与RAPD标记的遗传多样性，与平菇品种分化特征。