安塞县是黄土高原典型的丘陵沟壑区，由于特殊的自然条件和人类不合理的开发利用，导致生态环境恶化、水土流失严重，并严重制约着当地社会经济的发展，是我国生态与经济矛盾最为突出的区域之一。商品型生态农业正是为协调生态保护和经济发展而提出的。该模式的实施能使经济发展和生态保护彼此互为基础，相辅相成，相互促进。但是由于一些外在因素的限制，使得区域资源利用和产业发展不匹配，区域的经济发展和生态保护出现相悖的态势。本研究试图通过对商品型生态农业现状模式的诊断，选择能使该系统耦合优化的发展方案，以期为区域农业生态经济系统可持续发展提供参考。本文首先从耦合效率、经营效益和系统内部子系统的耦合度三个方面对安塞县商品型生态农业的现状进行评价；其次对安塞县商品型生态农业发展过程中主要指标演变的过程进行分析，与现状评价的结果相结合，用SWOT分析方法对安塞县商品型生态农业的发展进行定性分析，以明确区域商品型生态农业发展的内部机理和外部形势，找出系统优化的关键；最后按照政府对区域农业发展的干预程度和农户的行为选择，进行情境设置，并分别对不同情境运用线性规划法进行优化，选出目前适合区域发展的最优方案，实现系统耦合优化。得出如下结论：（1）通过从耦合效率、综合效益和耦合度三个角度对安塞县商品型生态农业的实施效果的评价，可以发现，系统总体而言处于低效率、低耦合、综合效益呈现下降的态势。具体而言，在耦合效率方面，近20a来，安塞县商品型生态农业的综合效率变化不大，多数年份的效率值在0.85以上，而这个相对效率的较高值，可能是各个年份的绝对效率较低导致的；技术效率呈现随机波动，先进技术没有发挥应有的作用或者是新技术引入不到位；规模效率相对较低，最低值为0.658，规模报酬在多数年份表现为规模报酬递增，说明个体小规模的农业经营模式已经不能适应新技术、新政策背景下农业的发展需求。在效率分析的同时发现，安塞县商品型生态农业在耕地面积急剧减少的情况下，通过其他要素投入的增加使产出持续增长，说明农业生产要素之间存在着替代性，发展中应重视投入要素的合理配置；在系统耦合方面，安塞县商品型生态农业正处于资源利用不足，产业发展滞后阶段，这是导致安塞县商品型生态农业出现经济效益下降，生态效益继续增长和综合效益下降的趋势的本质原因。（2）安塞县商品型生态农业结构不合理主要是农业资源利用和农业产业发展的不匹配导致的，是农业发展中链网结构的不完整的表现。林草资源的合理利用问题是安塞县未来农业发展急需解决的问题。(3)林草资源的合理利用是安塞县商品型生态农业系统耦合优化的关键点，政府不同程度的干预，将导致不同的资源利用效率。基于此，本文设置了五种不同情境：现有模式，完全市场化，半舍饲半放牧，统包统租，完全市场化下的小型合作组。根据目标函数值的大小，各种方案的排序依次为：完全市场化下的小型合作组>完全市场化>统包统租>半舍饲半放牧>现有模式。其中完全市场化下的合作组方案不仅经济效益值最高，而且它能逐步解放农村劳动力，有利于提高农户在市场上的讨价还价能力和承担风险的能力，有利于农户决策的理性化以及商品型生态农业的产业结构的优化。所以，完全竞争下的小型合作组方案是目前安塞县商品型生态农业发展阶段最适的发展方案。（4）完全竞争下的小型合作组方案下经济效益为272558.47万元，农林牧土地利用结构为：1:3.73:3.09，牛10000头，羊103019只，猪64351头，家禽145963只。与现有模式相比：在种植业方面，玉米、大棚蔬菜和苹果的种植面积大幅度上升，豆类和经济作物的种植面积大幅度下降，糜谷和薯类的种植面积基本保持平稳；在林草业方面，经济林全部变更为生态林和牧草地；在养殖畜牧业方面，猪和家禽的规模变化不大，羊和牛的养殖方式分别由全舍饲变为全放牧和半舍饲半放牧，羊的养殖规模大幅度增加，比现行模式增加了115.82%，牛的养殖规模有所下降，比现行模式减少了39.9%；在经济效益方面，完全竞争下的小型合作组的效益值比现行模式增加了31.95%。