福建地区草莓病毒的分子检测和SPaV全基因组序列的获得

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:laq_sky
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草莓是经济价值较高的浆果作物。目前我国是世界上草莓栽培面积最大、产量最高的国家。我国草莓病毒病发生普遍,生产上亦无有效的防治方法,草莓病毒病的发生严重影响了我国草莓产业的发展。福建省各地均有草莓种植,但对于草莓病毒病的种类、地理分布及发病程度尚缺乏全面系统的研究,为此,我们选取了 4种在我国发生较为广泛且危害严重的草莓病毒(SMoV、SMYEV、SVBV和SCV)以及在我国尚未报道的5种病毒(SPaV、SCrV-3、SCrV-4、BPYV和SPV1)作为研究对象,利用RT-PCR和高通量测序技术检测各病毒在福建省草莓主栽区的发生情况,结果表明,在待测草莓样品中共检出 SMoV、SMYEV、SVBV、SPaV、SCrV-3、SCrV-4 共 6 种病毒,SMoV的检出率为19.3%(18/93),其中检出SMoV的样品分别来自福州、漳州、三明和南平,各地检出率分别为福州69.2%(9/13)、漳州 40%(4/10)、三明 20%(2/10)和南平 30%(3/10)。SMYEV的检出率为3.2%(3/93),其中检出SMYEV的样品来自宁德,SMYEV在宁德的检出率为15%(3/20)。SVBV的检出率为31.1%(29/93),检出SVBV的样品来自福州、厦门、莆田、漳州、宁德和南平,各地检出率分别为福州92.3%(12/13)、厦门10%(1/10)、莆田50%(5/10)、漳州 90%(9/10)、宁德 5%(1/20)和南平 10%(1/10)。SCrV-3的检出率为2.2%(2/93),其中检出的SCrV-3样品来自福州,SCrV-3在福州的检出率为15.4%(2/13)。SCrV-4的检出率为3.2%(3/93),其中检出的SCrV-4样品来自福州,SCrV-4在福州的检出率为23.1%(3/13)。SPaV的检出率为3.2%(3/93),其中检出的SPaV样品来自福州,SPaV在福州的检出率为23.1%(3/13)。SCV、BPYV和SPV1的检出率均为0。其中SPaV、SCrV-3、SCrV-4这3种病毒为我国均为首次报道。草莓病株主要表现为长势变弱、叶片小、褪绿、扭曲变形和矮化等症状。利用RT-PCR结合RACE技术获得了 SPaV福州分离物的全基因组序列,SPaV福州分离物的RNA1长度为8048 nt,与 SPaV-M1(USA:Maryland)RNA1(AY488137)核苷酸同源性为 98%,RNA2 长度为 7977 nt,与 SPaV-M1(USA:Maryland)RNA2(AY488138)核苷酸同源性为99%,本研究结果可为草莓病毒病防治策略的制定提供理论基础和科学依据,SPaV全基因组序列的获得可为构建侵染性克隆的构建奠定基础。
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