本研究选取2017年4月（春季）与2018年3月（春季）厦门湾的两个航次,2017年8月（夏季）与2018年3月（春季）台湾海峡航次采集到的鱼卵、仔稚鱼样品进行DNA条形码分析,分析厦门湾和台湾海峡鱼卵、仔稚鱼的数量与种类分布,探讨环境因子对台湾海峡鱼类浮游生物分布的影响,具体研究成果如下:厦门湾两个航次的垂直拖网与水平拖网样品总共鉴定出鱼卵与仔稚鱼19种,获得鱼卵、仔稚鱼的COI基因序列76条,全部鉴定到种的水平,其中,3月份共4种,4月份共17种。厦门湾鉴定出的种类隶属于5目12科16属,其中鲈形目的鱼类种类最多,共11种,其次为鲱形目4种,鲉形目2种,鲻形目与鲽形目各有1种。厦门湾垂直拖网共获得鱼卵195粒,仔、稚鱼108尾,水平拖网获得鱼卵11705粒,仔、稚鱼661尾。垂直网的优势种类分别为3月斑鰶、暗缟虾虎鱼,出现率最高的种类是斑鰶,丰度高值区在同安湾;4月矛尾虾虎鱼、花鰶,出现率最高的种类是花鰶,丰度高值区在九龙江口,与其他亚热带海区种类组成结构相似。台湾海峡两个航次的垂直样品中,共鉴定出了鱼类128种,获得鱼卵、仔稚鱼的COI基因序列318条,14种鉴定到了科的水平,24种鉴定到了属的水平,90种鉴定到了种的水平,此外,3月（春季）航次中另有未定种12种。台湾海峡鉴定出的种类隶属于13目53科91属,鲈形目75种,其次为灯笼鱼目,10种,鲽形目、鲉形目与鲱形目各有8种,仙女鱼目和巨口鱼目各有4种,鲀形目3种,鲻形目、鼬鱼目、鳕形目各有2种,鳗鲡目和鲑形目各有1种。台湾海峡垂直拖网共获得鱼卵710粒,仔、稚鱼664尾。夏季无优势种出现,春季优势种为蓝圆鲹、金色小沙丁鱼、多鳞短额鲆,蓝圆鲹的出现频率最高,蓝圆鲹与金色小沙丁鱼均为闽南-台湾浅滩渔场的主要经济鱼类。春季台湾海峡环境因子的聚类分析结果表明,春季台湾海峡存在两个水团——南海次表层水和浙闽沿岸流,NMDS分析结果表明,这两股水团与鱼卵、仔稚鱼的集群有明显的相关性,鱼卵明显受水团影响更深。