高等学校(高校)的科研管理是促进高校为社会创造知识和科研成果而进行的业务管理，重视和加强高校科研工作，必须实施有效的科研激励机制。 本文全面地研究高校科研管理的激励机制。首先，按照公共管理科学的理论设计了高校科研激励政策的问卷调查方法，通过问卷调查和网络查询，收集了国内五十四位高校教师及三十所高校的科研激励政策，比较分析了这些高校的科研激励机制，发现了科研激励机制和科研评价指标体系中存在的问题。 其次，本文运用理论联系实践的方法和微观宏观相结合的方法，分析了产生这些问题的原因，发现问题存在的根本原因是社会环境、政治经济的宏观因素和高校管理者、教师自身微观因素相互作用作用的结果，高校的科研激励机制没有建立在现代激励理论基础之上。 进一步，利用需要激励理论、过程激励理论，本文从分析高校教师的需求入手，确定了影响教师的激励因素有高校教师的生存需要、高校教师的相互关系需要、高校教师的精神需要、高校教师的自我实现的需要；提出了高校应运用多元化的分层激励并辅以精神层面激励等原则，探讨了高校推行组织的卓越管理来构建科研激励机制：以激励的战略规划总揽全局，以服务教师为中心，以流程管理为主线，以人员管理为保证，以绩效评估为反馈的系统管理过程。其中，对高校科研评价体系的建立进行了初步探讨。 最后，提出应建立合理的信息反馈机制和监督机制，为高校激励机制的构建和实施提供保障。