【摘 要】
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目的:1.通过生物信息学的研究方法,利用Oncomine数据库及TCGA数据库探讨SKA3(纺锤体与着丝粒相关蛋白3)在早期乳腺癌的临床价值。2.探讨SKA3与中医证型及临床病理特征相关性,进一步挖掘乳腺癌的中医证型内在的分子生物机制。方法:1.首先利用Oncomine数据库及TCGA数据库探讨SKA3在早期乳腺癌的表达和预后预测价值。通过收集早期乳腺癌肿瘤组织和其配对的癌旁组织,采用实时荧光定量
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目的:1.通过生物信息学的研究方法,利用Oncomine数据库及TCGA数据库探讨SKA3(纺锤体与着丝粒相关蛋白3)在早期乳腺癌的临床价值。2.探讨SKA3与中医证型及临床病理特征相关性,进一步挖掘乳腺癌的中医证型内在的分子生物机制。方法:1.首先利用Oncomine数据库及TCGA数据库探讨SKA3在早期乳腺癌的表达和预后预测价值。通过收集早期乳腺癌肿瘤组织和其配对的癌旁组织,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-q PCR)和酶联免疫吸附剂测定(ELISA)检测乳腺癌肿瘤组织及对应的癌旁组织中SKA3基因的表达情况,进一步验证生物信息学的结果。2.收集临床中符合纳排标准的66例早期乳腺癌患者临床病理特征和中医证型。(1)分析乳腺癌肿瘤组织的SKA3表达与临床病理特征及中医证型的相关性。(2)探讨临床病理特征与中医证型的相互关系。结果:1.生物信息学研究(1)SKA3在多种肿瘤表达增高,SKA3在乳腺癌肿瘤组织高于癌旁组织(P<0.005)(2)SKA3基因与早期乳腺癌的年龄、T分期、N分期、TNM分期、ER、PR、分子分型等临床病理特征有紧密联系(P<0.005)。(3)SKA3基因高表达与较差的总体生存期(P=0.0017)、无疾病生存期(P=0.0013)显著相关。(4)基因富集(GSEA)的途径包括m TORC1信号通路、MYC靶点V1、有丝分裂纺锤体、早期雌激素反应。2.实验研究(1)66对乳腺癌组织和其配对癌旁组织的RT-q PCR结果显示:早期乳腺癌肿瘤组织中SKA3 m RNA表达高于癌旁组织(P=0.010)。乳腺肿瘤组织中SKA3 m RNA相对表达量中位值为1.642,而癌旁组织SKA3 m RNA相对表达量中位值为1.294。乳腺肿瘤组织中SKA3表达量是癌旁组织的1.3倍。分子分型中,SKA3表达量为三阴性乳腺癌>HER2阳性乳腺癌>luminal B型乳腺癌>luminal A型乳腺癌(P=0.000)。而SKA3在乳腺癌术前中医证型(肝郁痰凝、冲任失调、痰瘀互结、正虚毒炽)的表达不具有统计学差异(P=0.478)。(2)38对乳腺癌组织和其配对癌旁组织的ELISA结果显示:SKA3在早期乳腺癌肿瘤组织高于癌旁组织(P=0.001),与RT-q PCR结果一致。(3)SKA3的表达与ER、PR、AR、分子分型有相关性(P<0.05),但与年龄、T分期、N分期、TNM分期、绝经状态、HER2、ki67、病理类型、组织学分级无相关性。(4)早期乳腺癌患者的术前中医证型主要为肝郁痰凝(34.8%)、冲任失调(31.8%)。肝郁痰凝和T分期、ER、PR、TNM分期、AR有相关性,痰瘀互结与绝经状态相关,正虚毒炽与T分期相关(P<0.05)。但未发现SKA3与早期乳腺癌中医证型有相关性。结论:1.SKA3在早期乳腺癌中肿瘤组织高表达,且在三阴性乳腺癌表达最高。2.SKA3与早期乳腺癌的病理临床特征(ER、PR、AR、分子分型)密切相关,提示SKA3在早期乳腺癌中具有潜在的临床价值。3.SKA3在早期乳腺癌的术前中医证型分布主要集中在肝郁痰凝、冲任失调。提示疏肝解郁、调理冲任是乳腺癌重要的治法治则。未发现SKA3与乳腺癌术前中医证型具有相关性。
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