超级增强子驱动EphA2影响HCT-116细胞生物学特性的研究

来源 :哈尔滨工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sjzshiyijshan
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超级增强子(Super Enhancers,SEs)是基因组上一段具有高度活性和细胞类型特异性的DNA序列,通过调节细胞类型特异性基因的时空表达从而决定细胞的命运。研究表明,超级增强子不仅可以驱动非编码RNA(non-coding RNAs,nc RNAs)的转录表达,间接调节生物功能,而且在肿瘤的发生和发展过程中起关键作用。在前期研究中识别并鉴定了一个在多种肿瘤中具有活性的新型超级增强子EphA2-SE,但其组分增强子在结肠癌中的具体作用机制还未知。因此,本课题通过建立EphA2-SE组分增强子的敲除细胞系进一步探究其在结肠癌发生发展的功能。首先本课题利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在HCT-116细胞中构建EphA2-SE组分增强子缺失的敲除细胞系,并通过检测发现没有发生脱靶效应。实时定量PCR、Western Blot以及免疫荧光实验的结果显示EphA2-SE及其组分增强子的缺失能够降低靶基因EphA2在HCT-116细胞中的表达。而MTT比色法、细胞平板克隆实验以及Transwell实验的结果表明EphA2-SE及其组分增强子的缺失能够抑制HCT-116细胞的增殖、迁移和侵袭能力。综上所述,EphA2-SE及其组分增强子通过影响靶基因EphA2的表达从而介导结肠癌HCT-116细胞的生物学特性,为进一步阐明超级增强子在肿瘤发生发展中的功能奠定良好的基础。
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