90年代,世界经济开始从工业经济转向知识经济,国家创新系统理论逐渐受到学术界的认可。在对欧美国家创新系统的研究中,多数研究认为同时重视知识创造与技术创新的国家更加适应知识经济时代。高校作为知识的发现者和创造者之一,其所创造的知识对经济社会有着深远的影响。但根据新古典学派理论,创新活动本身具有不确定性,且创新产出属于准公共产品,因此高校的创新活动需要政府的适当干预。中国政府对高校创新活动资助体系为国务院—部委—学校—研究者四级。国务院制定国家科技发展规划,四部委结合部门规划确定研发投入。因此,我国的资助体系属于包含较强国家意志的分散式。2001年课题制确立后,根据投入方式,政府研发投入可分为竞争性投入与非竞争性投入。此外,创新活动根据研究内容可分为基础研究活动、应用研究活动与试验发展活动三类。高校的创新活动主要为前两者,由此根据创新活动类型,政府研发投入可主要分为基础研究投入与应用研究投入。首先,论文对高校创新活动的现状进行了描述性分析,发现我国政府研发投入规模呈较为明显的增长趋势,投入结构呈现“重竞争性投入,轻非竞争性投入”、“重应用研究投入、轻基础研究投入”的特征。其次,结合其他学者的研究,论文从规模与结构两个角度提出了三个研究假说:H1:政府研发投入规模对高校创新产出的影响不仅与衡量指标的价值取向有关,还与高校人力资本投入中质量与数量的相互作用有关;H2:竞争性投入与非竞争性投入对高校创新产出的影响存在差异;H3:基础研究投入与应用研究投入对高校创新产出影响存在差异,且这种差异与时间有关。再次,论文以2004年-2016年的省级面板数据,运用工具变量GMM方法,对研究假说进行计量分析并解释其估计结果。此外,为了保证估计结果可靠性,论文从延长滞后期、缩小研究样本、改变衡量指标三个方面进行稳健性分析。研究结果表明:(1)对于更具技术价值的专利授权,政府研发投入规模对发明专利授权有显著影响,但对非发明专利没有显著影响;对于更具市场价值的专利出售合同,政府研发投入对其无显著影响。(2)在投入方式中,竞争性投入对发明专利授权有显著影响,但非竞争性投入对其没有显著影响。(3)在投入活动类型中,基础研究投入与应用研究投入皆对发明专利授权有显著影响,且后者影响较大。最后,论文分别对研究中发现的投入结构不合理、创新产出市场化程度不足、体制缺陷等问题,从以下三个方面提出政策建议:进一步发挥政府引导作用,增加高校研发投入;完善高校科研经费管理体制与产出评价体系;从质量与数量两个方面增加高校人力资本投入。论文主要从规模与结构两个角度,研究了政府研发投入规模对于不同价值取向创新产出的影响以及政府研发投入结构对于高校创新产出的影响两个问题。这在一定程度上,深化了政府研发投入对高校创新产出的理论机理,丰富了高校创新方面的研究文献。同时,论文研究结论对我国在经济转型升级中,政府如何根据投入结构,进一步发挥政府研发投入的积极作用做出了一定的贡献。