【摘 要】
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该文首先介绍了机群系统的研究现状和研究的目的,并分析了分子动力学模拟计算在机群上应用的必要性,以及该文的研究目的.然后介绍了Linux并行计算机群的配置和组建.该文主要
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该文首先介绍了机群系统的研究现状和研究的目的,并分析了分子动力学模拟计算在机群上应用的必要性,以及该文的研究目的.然后介绍了Linux并行计算机群的配置和组建.该文主要介绍的是机群计算在分子动力学计算上的应用,根据分子动力学的特点,在Linux机群的PVM平台上利用空间分解法实现了串行算法到并行算法的改变.作者所实现的机群系统具有检查点机制、容错和负载平衡的功能.作者所实现的检查点机制是根据分子动力学的特征,在用户区实现的,这样比较易于实现而且冻结时间短.容错包括两个方面,一是防止单点的不可用,二是整个系统的断点保存与恢复.负载平衡采用的是静态负载平衡和动态负载平衡相结合的策略.动态负载平衡是利用任务迁移来实现的,同样它也是在用户区实现的.最后作者采用实验来加以验证系统的可靠性.
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