质谱仪对我院呼吸内科住院患者细菌鉴定及同源性分析

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目的:对我院2020.10-2021.11呼吸内科住院患者临床分离病原菌进行培养鉴定及药敏实验,分析我院呼吸内科病原菌分布与药敏谱变化,为临床经验性使用抗菌药物提供参考依据;利用质谱仪对呼吸内科分离培养同一种属病原菌分别进行同源性分析,查看病原菌之间的亲缘性关系,为院感科监测院内感染及制定防控措施提供实验室依据。方法:1研究对象:收集我院2020.10-2021.11呼吸内科住院患者送检标本分离培养病原菌,并主要对分离培养前三位病原菌展开探讨。2病原菌与药敏谱:应用VITEK2 Compact对病原菌进行药敏试验,使用WHONET5.6进行药敏结果分析,其中耐碳青霉烯肺炎克雷伯氏菌(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)、耐碳青霉烯铜绿假单胞菌(Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,CRPA)、耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)为药敏试验中亚胺培南或美罗培南耐药菌株。3耐药表型分析:根据CLSI M100-30S操作流程对27株CRKP进行改良碳青霉烯灭活实验(m CIM)及EDTA改良碳青霉烯灭活实验(e CIM)。4临床资料收集:收集感染耐碳青霉烯病原菌患者性别、年龄、住院天数、慢性呼吸系统疾病及有创机械通气史等临床资料进行危险因素分析。5病原菌同源性分析:利用VITEK MS RUO模式及SARAMIS软件对CRKP、CRPA、CRAB进行同源性分析。6统计学方法:使用SPSS26.0对实验数据及临床资料进行统计学分析。结果:1我院2020.10-2021.11呼吸内科住院患者分离培养病原菌207株,检出病原菌标本分布中痰标本和尿液标本占比较大,分别为178例(85.99%)、21例(10.14%)。207株病原菌中革兰阴性菌为181株(87.44%),革兰阳性菌22株(10.63%)和真菌4株(1.93%)。其中前三位病原菌分别是肺炎克雷伯氏菌58株(28.02%)、铜绿假单胞菌44株(21.26%)及鲍曼不动杆菌34株(16.43%)。2应用WHONET5.6对我院呼吸内科分离培养病原菌进行药敏结果分析:(1)58株肺炎克雷伯氏菌药敏结果显示:替加环素、头孢他啶/阿维巴坦、阿米卡星耐药率分别为4.47%、5.97%、8.90%,美罗培南、亚胺培南、头孢吡肟耐药率分别为29.40%、33.90%、35.70%。27株CRKP进行m CIM和e CIM实验结果显示:产金属β内酰胺酶14株(51.85%),产丝氨酸碳青霉烯酶12株(44.44%),不产酶1株(3.70%)。(2)44株铜绿假单胞菌中黏菌素、庆大霉素耐药率分别为0.00%、4.50%,亚胺培南、环丙沙星、美罗培南耐药率分别为27.50%、27.50%、36.00%。(3)34株鲍曼不动杆菌中黏菌素、替加环素耐药率分别为0.00%、2.80%,美罗培南、头孢曲松、亚胺培南耐药率分别为52.90%、58.80%、63.20%。3 CRKP、CRPA、CRAB检出率分别是33.92%、35.29%、63.16%,呼吸内科CRKP检出率显著高于全院数据(P<0.05),CRPA、CRAB检出率与全院数据相比无统计学差异(P>0.05)。多因素分析显示慢性呼吸系统疾病(OR=4.088,95%CI=1.610-10.380)及有创机械通气史(OR=13.044,95%CI=4.612-36.889)为耐碳青霉烯病原菌感染的危险因素。4将CRKP、CRPA、CRAB进行同源性分析结果显示:(1)CRKP基本呈一簇阶梯状分布,变异性较小,相似性分型中6株聚集在85%-90%之间,13株聚集在80%-85%区间,6株在70%-80%区间,2株聚类分析在70%以下;85%-90%区间分布的6株病原菌中除编号082206外,其余5株均聚集在2021.1-2021.3时间段,为本地区冬春季节。(2)CRPA菌株分布较分散,2株分布在85%-90%区间,1株处在80%-85%区间,19株分布在70%-80%区间,1株分布在70%以下。(3)CRAB菌株分布中2株分布在85%-90%区间,5株分布在80%-85%区间,11株在70%-80%区间分布,7株在70%以下。结论:1我院呼吸内科住院患者临床分离病原菌前三位分别是肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌及鲍曼不动杆菌,三种病原菌对临床常用抗菌药物存在不同程度耐药。2慢性呼吸系统疾病及有创机械通气史为耐碳青霉烯病原菌感染的危险因素。3 MALDI-TOF MS同源性分析技术可以对耐碳青霉烯病原菌进行实时监测,查看病原菌传播趋势,院感科可以根据质谱仪同源性分析数据为呼吸内科制定有效的防治措施。
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