【摘 要】
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近年来基因组测序技术发展迅速,但基因组的从头组装技术却依然面临严峻挑战。基因组从头组装技术中最难攻克的是scaffolds序列的定位及排序问题。在已测序的亚洲棉基因组中,通过遗传图谱将3740个scaffold序列锚定定向到了13条染色体上。然而通过各种序列比对分析如对相近物种的序列进行同线性及共线性分析,发现亚洲棉的基因组测序草图中存在各种错误组装。为了解决这个问题,我们利用遗传图谱与有参组装相
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近年来基因组测序技术发展迅速,但基因组的从头组装技术却依然面临严峻挑战。基因组从头组装技术中最难攻克的是scaffolds序列的定位及排序问题。在已测序的亚洲棉基因组中,通过遗传图谱将3740个scaffold序列锚定定向到了13条染色体上。然而通过各种序列比对分析如对相近物种的序列进行同线性及共线性分析,发现亚洲棉的基因组测序草图中存在各种错误组装。为了解决这个问题,我们利用遗传图谱与有参组装相结合的方法对亚洲棉A12染色体进行了更为精准的组装。重新组装后的亚洲棉A12染色体长达94.64Mb,包
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