本文主要研究了长江口北支湿地生态环境特征和生物多样性以及自然保护区建设三个方面的内容。研究结果表明:(1)长江口北支湿地是融海岸潮滩湿地生态系统、河口湿地生态系统和人工湿地生态系统为一体的复杂系统,生境类型丰富、异质性高,具有较高的初级生产力,是迁徙鸟类良好的栖息地和觅食地。但其生态环境质量一般,受人类外界干扰较大,亟需采取科学、有效的保护措施。(2)在自然条件下,长江口北支湿地的沙洲、滩涂湿地植被具有明显的成带分布特征,由外到内依次为:光泥滩-藻类盐渍带-海三棱藨草群落带-藨草群落带-芦苇群落带-中生植被带,自然演替的基本模式为:光泥滩→藻类盐渍滩→海三棱藨草群落→藨草群落→芦苇群落→中生植物群落。这种自然演替模式随着滩涂(或沙洲)淤积增高和面积的扩涨,即按高程从低到高的顺序进行。(3)长江口北支湿地有种子植物57科157属212种。种子植物区系成分具有以下特点:种的地理成分相对简单;表现出明显的亚热带特征,并具有热带向温带过渡的特点;菊科、禾本科、豆科占有绝对优势,构成植物区系的骨干;种子植物主要由草本植物组成,草本植物占绝对优势。海三棱藨草群落、藨草群落和芦苇群落是三种主要的湿地植物群落类型。植物群落处于演替的初级阶段,植物群落结构简单,生物多样性偏低,植被具原生性,物种组成单调,多数情况下形成单种植物群落。(4)长江口北支湿地有鸟类16目41科216种。候鸟种类最多,旅鸟次之,留鸟仅占较小比例;候鸟中又以冬候鸟为主,夏候鸟种类较少。珍稀和濒危鸟类较多。鸻鹬类、雁鸭类、鹭类和鸥类为主要类群。鸟类科间多样性和属间多样性均较高,鸟类在科属间的分布均匀,非单种科多。光滩和藻类盐渍带、堤内养殖塘、藨草和海三棱藨草带以及芦苇带四种典型生境是水鸟的主要活动区域。芦苇带与其他三种生境的鸟类群落的组成有较大差异,鸟类群落的物种多样性以堤内养殖塘最高,芦苇带最低。(5)本文以MacArthur、Wilson提出的岛屿生物地理学理论和Diamond等提出的自然保护区设计的主要原则为主要理论依据,结合异质种群理论、生态演替理论、可持续发展理论以及启东市土地利用状况和社会经济状况对启东长江口北支湿地自然保护区进行了规划和功能区划,提出了保护区可持续发展的途径,包括生态学措施、产业发展措施和政策措施。