随着人们对寄生虫病的不断研究和认识，发现圆线虫在马属动物体内的寄生十分普遍，以宿主的大肠为主要寄生器官，以消化液等作为主要的营养来源。圆线虫首先削弱动物个体的免疫能力，然后引起一系列的其它病症反应，严重的会导致染病个体的死亡，所以严重威胁着畜牧养殖业的生产。因此，圆线虫的预防和治疗显得尤为重要，而传统的形态学方法有时不能准确鉴定致病圆线虫，系统的、全面的分析成为圆线虫调查研究的方向。目前，国外学者对圆线虫的研究较为深入，已经有了较多的资料和数据，然而国内的研究情况，却并不容乐观。在国内，更多的仅限于形态学方面的研究，系统性的研究还相对缺乏，特别是在分子生物学研究方面，存在着许多的空白。本论文首次对4种杯冠属线虫（采自河南新乡地区驴体内）的形态及分子系统发育学方面进行研究。　　本研究以寄生在驴体内的4种杯冠属线虫（小杯杯冠线虫（Cylicostephanuscalicatus），高氏杯冠线虫（C.goldi），长伞杯冠线虫（C.longiburs）和微小杯冠线虫(C.minutus)）为研究对象，通过光镜观察和测量，并利用扫描电镜对虫体的体表结构做进一步的观察和描述，为杯冠属线虫的分类提供更加可靠的依据。本实验观测到的虫体形态结构，与以往研究记载相比较基本上是一致的。　　通过对研究材料的DNA提取和序列测定，结果可知:杯冠属的4种线虫共获得6条rDNA-ITS序列(ITS+5.8S)，通过多序列比对分析发现，全序列总长度为740-842bp，其中5.8S区碱基完全一致，长度均为153bp;所含变异位点共93个，占总位点13.53％-15.84％，简约信息位点共65个，占总位点9.4％-11.07％;其中ITS1区长为367-372bp，变异位点为32个，简约信息位点为23个;ITS2区长为215-320bp，变异位点为61个，简约位点为42个，ITS2区相比ITS1区变异性更大。结合从数据库中获得的该属内5个种的6条序列，ITS-1区和ITS-2区的G+C含量分别为:47.70％-48.66％和38.14％-40.78％。所测得的6条序列的经过两两比对分析得知，种间差异性（ITS1和ITS2）计算结果为:1.080％-7.77％和3.75％-48.16％。因此，该属种间的ITS1序列差异性较小，而ITS2序列的差异性较大;种内差异性结果为:0.00-0.27％和0.31-0.47％，由此可见，ITS序列的种内差异非常小。其中微小杯冠线虫比较特殊，与其它种类线虫的种间差异（6.43-7.77％和46.63-48.16％）明显大于其它各种间差异（2.17-1.08％和3.75-9.40％）。最后以马圆线虫为外群，结合Genebank中取得已记载的所有杯冠属线虫，共计13条序列，通过MegaS.0作遗传距离分析，构建MP和NJ发育树。结果显示，MP和NJ树的拓扑结构完全一致，共分为两大支，这两大支又各自有自己的小支分布。微小杯冠线虫在基部单独聚为一支，其他种类聚为一支，这说明微小杯冠线虫与其他种类的亲缘关系比较远，其它四种线虫的关系较近。而从其它四种线虫聚集情况看可知，与长伞杯冠线虫的亲缘关系由近及远，依次可表示为:高氏杯冠线虫，小杯杯冠线虫，双齿杯冠线虫。