按照结构功能主义的观点,大学属于具有文化、教育和揭示功能的模式维持组织,大学行政管理功能只有通过合理的组织设置,使其在科学的行政组织机构中相互作用,才能产生较好的功用并得以较好地理解。　　“985”大学作为我国的研究型大学,在扩招和院校调整下,规模迅速扩张,管理难度增大,其内部行政组织机构的管理职能随之增多,复杂性增强。“985”大学校级行政管理系统所设机构与教育行政主管机构设置呈对应关系,大学行政组织机构的部门划分标准与教育行政主管机构的部门划分标准具有内在的统一性,其职能(功能)具有相同或相似性;“985”大学行政组织机构存在的问题可归纳为组织机构和权力构成两个方面,在组织结构方面表现为管理层级偏多和组织机构庞大,在权力构成方面表现为权力制衡体系不完善和权力结构过于集中。科层式的行政权力模式及运行机制是这些问题存在的根本原因。“985”大学在组织结构上以学术组织和行政组织两大组织机构构成并运行,并以行政级别实现互通,统一于一个等级分明的权力系列。　　“985”大学行政组织机构改革需要通过平衡政治权利和行政权力,进而下放大学管理权力来实现,应从以权力配置为中心的领导体制、组织结构以及协调机制等方面入手;应树立以学术为取向的大学行政理念,由行政管理向服务学术转变;应遵循目标任务、权力下放、权责对等、分工协作、高效优化、稳定灵活六大原则;应以提炼核心价值观、推进大学行政组织机构职能转变为核心使命,以明确大学行政组织目标、精简机构和人员为主要手段,以设计开发持续工作流程、管理重心下移为分权方向。　　“985”大学行政组织机构应根据自身的职能定位重新设置其内部的工作团队,应该摒弃等级分明的行政级别,全面实行职员制;同时,可根据工作的阶段性和临时性的需求,在保证工作团队相对稳定的前提下,对个别团队作出适时调整或组建新团队。