近年来,由重大动物疫情引发的公共危机事件频频发生,对于人类的生命安全和养殖业的健康生产都产生了巨大的影响,及时对疫区内的病畜进行隔离扑杀是目前控制动物疫情蔓延的主要手段之一。探讨重大动物疫情隔离和控制问题具有重要的现实意义。在实际隔离扑杀过程中,地方政府作为隔离工作的主导者和疫区农户之间存在博弈关系,他们的行为决策对危机事件的演变起着重要的作用,且政府行为在很大程度上对于疫区农户具有引导作用。本文以禽流感疫情为例,通过农业部官方网站搜集了2005-2016年的各地扑杀补偿数据,利用描述性统计分析结合具体案例对比,分析不同地方政府在疫情中对农户的行为引导在动物疫情公共危机整体演化中发挥的作用。然后基于政府公信力和官民信任感,构建地方政府和疫区农户的演化博弈模型,并从动态角度分析两个主体的演化稳定策略和演化规律。利用MATLAB软件对博弈模型进行数值仿真模拟,分析政府对农户的行为引导和演化稳定策略的主要影响因素,为疫区隔离扑杀工作顺利推进提供一定的参考,并探讨与我国当前动物疫情公共危机应急管理相适应的公共政策,如何发挥政府在动物疫情应急管理中的对农户的正向行为引导作用,是本文的研究最终目的和意义所在。研究表明,政府和疫区农户的策略选择主要受到政府公信力和信誉的得失、政府和疫区农户在采取不同策略下所获得的剩余利润以及疫区农户的维权成本影响。地方政府和疫区农户在完成疫区隔离扑杀目标和农户得到合理补偿的双赢基础上进行合作,是疫区隔离问题的帕累托最优均衡,政府需要通过制定合理的扑杀补偿政策等行为引导农户的策略选择向这一均衡点演化。最后,针对政府在隔离扑杀机制中存在的问题,提出能够减少由于疫区强制隔离扑杀引发的群体性突发事件、优化政府与农户演化博弈路径、加强政府对疫区农户正向引导的相关建议。