二十世纪九十年代,随着人类基因组计划的开展,极大地促进了基因组学和蛋白质组学的发展,人们获得了海量的氨基酸残基序列和蛋白质序列。但在蛋白序列数据迅猛增长的同时,蛋白质结构测定却显得相对滞后。膜蛋白约占整个蛋白质序列的30％,但却仅有1%的膜蛋白结构被测定出来。膜蛋白作为细胞膜的一部分,其已知的作为细胞间通信、调节细胞膜内外溶质与离子传输、细胞的“感觉器官”等功能在维持生物体正常运转中起着重要作用。由于蛋白质结构与功能之间密切的关系,如果能测得蛋白质的结构,那么就可以在一定程度上推断它具有的功能。膜蛋白受体作为绝大多数药物靶点,如能预先测得其结构特征,那么在新药物的研制过程中必会产生巨大的效益。　　 本文主要研究预测膜蛋白跨膜螺旋。目前,基于特定位置得分矩阵(position-specificscoring matrix,PSSM)的膜蛋白跨膜螺旋预测取得了比较好的结果。但是使用PSSM进行膜蛋白跨膜螺旋预测仅仅使用了序列进化信息,膜蛋白还有许多其他的物理化学性质也可以应用到跨膜螺旋预测中来。典型的如氨基酸的疏水性、分布倾向性都曾经作为基础信息用于跨膜螺旋预测。本文的中心思想是以PSSM为基础,分别引入氨基酸的疏水性、结构倾向性、分布倾向性并观察预测结果。具体做法是使用主成分分析(principal component analysis,PCA)对PSSM进行特征提取,获得包含序列进化信息的特征,并以此为基础,分别加入结构倾向性、疏水性、分布倾向性特征,应用特征融合的方法,对膜蛋白跨膜螺旋区域进行分类预测,得到了较好的预测结果。　　 标准数据集上的实验结果表明,本文基于多特征融合的方法在预测精度的五类评价指标上均有提升,特别是在末端准确率上提高明显,是一种有效的膜蛋白跨膜螺旋预测方法。