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背景及目的非综合征性唇腭裂（nonsyndromic orofacial clefts,NSOC）在全球范围内是人类最常见的颅面部先天畸形,并且使得罹患个体和社会都承担着巨大的负担。患者会面临进食困难、言语、听力以及牙齿的问题。尽管裂隙可以通过手术的方式修补,但是患者会遭受多次颅面和牙齿的手术,以及语言和听力方面的治疗。即便有这些干预措施,患者也要经历长达一生的来自畸形的心理影响。大量研究表明,NSOC是一种复杂的疾病,是由遗传因素和环境因素以及两者之间的交互作用引起的。叶酸缺乏、母亲吸烟和饮酒都被发现与NSOC的发生有相关性。最近,Luca Scapoli等研究表明位于染色体6p区域的JARID2基因（jumoji AT-rich interaction domain 2）是与NSOC相关的一个候选基因。JARID2是一个转录抑制因子,是JumonjiC（JmjC）家族的一员,该基因在胚胎发育期间起关键作用。一项基于家系的连锁不平衡研究中,发现了JARID2基因的三个单核苷酸多态性位点（single-nucleotide polymorphisms,SNPs）rs2076056,rs2237138和rs2299043在意大利人种家系中呈现显著相关性。因此,本研究的目的是分别探讨JARID2基因多态性、环境危险因素与NSOC的相关性。方法第一部分:研究JARID2基因多态性与中国北方汉族人群NSOC的相关性本研究收集了299例NSOC患者作为病例组,325例正常健康人（不伴全身系统疾病和遗传病）作为对照组,抽取他们的外周静脉血并提取全基因组DNA。我们选择了JARID2基因上的三个SNP位点:rs2076056,rs2237138和rs2299043,选择标准为:1、前期研究证明与NSOC有相关性;2、在HapMap数据库中,SNP在中国人群的最小等位基因频率至少为20%。运用SNaPshot的方法进行基因分型。我们检测了病例组和对照组的哈迪温伯格平衡,三个SNP位点的等位基因频率和基因型差异用卡方检验计算,逻辑回归的方法检测基因型的比值比（odds ratios,ORs）和95%可信区间（95%confidence interval,CI）。以上统计学分析均用SAS v9.1.3统计学软件分析。三个位点的单体型用SHEsis在线软件分析。D’和r2值表示连锁不平衡,以上分析P<0.05表明差异有统计学意义,OR>1表明该因素会增加疾病分风险。第二部分:研究父母环境暴露和母亲补充剂的摄入与NSOC的相关性我们进行了一项回顾性病例对照流行病学研究,病例组和对照组样本量分别为499和480,通过对母亲进行问卷调查的方式收集孕前一个月到孕期前三个月期间相关信息,包括社会人口学特征如母亲生育年龄、患儿性别、父母文化程度,家庭年收入、母亲怀孕次数、母亲体质指数（body mass index,BMI）和母亲不良孕产史和围孕期父母危险因素暴露如母亲孕期患病史,用药史,吸烟史,饮酒史,负性生活事件史,不良职业暴露和补充剂的使用。运用单因素Logistic回归分析统计各组之间的差异,P<0.05表明差异有统计学意义,将有统计学意义的因素录入多因素Logistic回归模型进一步计算。结果第一部分:rs2237138位点的基因型分布在唇裂伴或不伴腭裂组（cleft lip with or without palate,CL/P）和对照组之间差异有统计学意义（P=0.04）。与野生型纯合子AA相比,rs2237138位点的GG基因型可能会降低CL/P的风险（OR=0.34,95%CI=0.13-0.84）。单体型分析中,发现三个位点的携带CGT单体型的个体在CL/P组与对照组之间差异有统计学意义（P=0.04）,而携带GAT单体型的个体在单纯腭裂（cleft palate only,CPO）组与对照组之间差异有统计学意义（P=0.02）。第二部分:问卷调查结果表明,母亲发热史(ORCL/P=3.11,95%CI:1.67-5.82;ORCPO=3.31,95%CI:1.58-6.94),感冒史(ORCL/P=5.56,95%CI=2.96-10.47;ORCPO=8.23,95%CI=4.08-16.95),父亲吸烟(ORCL/P=2.15,95%CI:1.37-3.38;ORCPO=1.82,95%CI=1.06-3.13),父亲饮酒(ORCL/P=5.04,95%CI=3.00-8.46;ORCPO=4.40,95%CI=2.50-7.74),母亲孕期暴露于有机溶剂(ORCL/P=6.07,95%CI=1.49-24.76;ORCPO=10.65,95%CI=2.54-44.67)重金属(ORCL/P=5.67,95%CI=1.34-24.09;ORCPO=7.28,95%CI=1.41-37.63),农药(ORCL/P=5.97,95%CI=2.10-16.98;ORCPO=3.48,95%CI=1.06-11.46)会增加后代发生CL/P和CPO的风险,母亲皮肤病史(ORCL/P=12.07,95%CI=1.81-80.05),负性生活事件史(ORCL/P=1.67,95%CI=1.95-2.67)会增加后代发生CL/P的风险,母亲孕前服用多种维生素会降低后代发生CL/P和CPO的风险(ORCL/P=0.06,95%CI=0.02=0.23;ORCPO=0.06,95%CI=0.01-0.30)。结论首先,本实验研究发现JARID2基因多态性与非综合征性唇腭裂之间有相关性,表明JARID2基因可能为NSOC的候选基因并有待进一步研究;其次,父母围孕期环境危险因素暴露及母亲服用多种维生素与后代发生NSOC的风险有相关性。