高新技术代表未来技术和产业的发展方向,是国家之间技术、经济等方面竞争的制高点,它不仅带来科学技术的飞速发展,而且会引起全球性的产业结构的根本变化,促使生产力快速发展。高新技术企业是技术创新活动重要的载体,在推动国家和地区技术创新、技术进步方面、推动产业结构升级和提高劳动生产率和经济效益有着不可替代的作用。技术创新是实现我国高企业技术进步和技术突破的关键,但不是所有的技术创新活动都能够预期的技术成果和经济效益,这是由于技术创新资源的投入在技术创新过程中没有得到充分的利用与合理配置,因此研究高新技术企业的技术创新效率差异并分析影响技术创新效率差异的原因对未来高新技术企业的发展有着重要的意义。本文在基于创新的过程系统构建技术创新效率的测量指标,并从资源和能力角度分析影响企业技术创新效率的因素。本文采用两种不同的方法测算浙江省高新技术企业的技术创新效率和影响因素,首先,以超越对数生产函数的函数形式,测算了浙江547家高新技术企业技术创新效率,采用B&C(1995)的联立方程模型分析了技术创新效率差异的影响因素。得出研发人员和研发资金对以新产品销售收入为创新产出的投入产出弹性,并得出研发人员和研发资金配置不合理的结论。其次,采用数据包络分析(DEA)方法测算高新技术企业的综合技术效率,纯技术效率和规模效率,结果显示技术创新效率存在显著差异,并用多元回归分析方法对差异性的原因进行了进一步深入的分析。两种不同的方法得出的结论非常相近,互为补充,相互印证,这充分说明了本文研究结论的可信性。本文研究发现,虽然浙江省高新技术企业技术创新效率创新效率值不高,而且差异比较大,但是都处在规模效益递增的成长阶段。通过对效率值差异的原因进行分析,发现规模、负债率、盈利能力、运营能力对企业创新效率有着显著的影响,研发人员密度对创新效率影响没有显著影响,传统产品出口对创新效率有消极的影响作用,高新技术产品出口能促进企业的技术创新效率,政府支持中的税收减免也对高新技术企业的创新效率有着显著的正向影响。同时,根据本文的研究结论,对提高浙江省高新技术企业创新效率提出了相关的政策建议。