西施舌（Coelomactra antiquata）隶属于软体动物门（Mollusca）双壳纲（Bivalvia）异齿亚纲（Heterodonta）帘蛤目（Veneroida）蛤蜊科（Mactridae），是我国重要的经济贝类。本研究首次测定了西施舌线粒体全基因组，西施舌线粒体基因组全序列长度为17190bp，基因组（A+T）碱基比例为64.7%。整个线粒体基因组编码34个基因，包括12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和20个tRNA基因，西施舌线粒体基因组也缺少了两个tRNA： tRNA^Ser（AGN）和tRNA^Ser（UCN），也缺失了基因atp8。西施舌线粒体基因组的所有的基因都编码在同一条链上。在西施舌线粒体基因组最长的非编码区中，发现了8.9个拷贝的99bp的串联重复序列。另外，西施舌的线粒体基因排列也与其它物种存在很大差别，是一种新的基因排列顺序。琴文蛤隶属于软体动物门（Mollusca）双壳纲（Bivalvia）异齿亚纲（Heterodonta）帘蛤目（Veneroida）帘蛤科（Veneroidae）文蛤属（Meretrix）。本研究测定了琴文蛤线粒体基因组序列7505bp，在获得的序列中包含了cox3和cytb基因的部分序列；5个完整基因的序列：cox1、nad1、nad2、nad4L、cox2；5个tRNA基因：tRNA^Ala、tRNA^Leu（CUN）、 tRNA^Ile、tRNA^Asp、tRNA^Pro以及10个非编码区域。将琴文蛤已测定的5个完整蛋白质编码基因与文蛤属四个物种（文蛤M. meretrix，丽文蛤M. lusoria,斧文蛤M. lamarckii，短文蛤M.petechialis）比较，发现5个基因的起始密码子以及终止密码子存在一定差别。本研究基于cox1、cox2、nad1、nad2、nad4L五个基因基础上，构建了文蛤属5个物种的NJ系统发生树。本研究结果支持文蛤属为单系发生，文蛤M. meretrix与短文蛤M. petechialis具有很近的亲缘关系，但是两个物种是否为同一物种，需要今后结合其形态上的数据才能得出更确定的结论。