常见大型真菌基因组研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:ning0001
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大型真菌即为有可观察到的子实体的真菌。许多物种的子实体通常被称为蘑菇,并被世界各地的人们作为食物和/或药物使用。大多数大型真菌属于担子菌和子囊菌,据估计其总共包含80,000多种。在这项研究中,我们使用Illumina测序,组装了90种大型真菌(83种担子菌和7种子囊菌)基因组草图。这些物种的基因组大小范围从27.4 Mb(Hygrophorus russula)到202.2 MB(Chroogomphus rutilus)。预测的蛋白质编码基因的数目在9,511 bp(Hygrophorus russula)至52,289bp(Craterellus lutescens)的范围内,平均基因长度在924 bp~1,741 bp之间。我们还对这些物种进行了进化分析(基因家族聚类、系统进化树的构建和分歧时间计算)和比较基因组学(CAZymes和Microsatellites鉴定)的分析。本研究为大型真菌种提供了大量的的基因组数据集。该资源将有助于人工种植食用菌和发现新的候选药物。这些结果还将为比较基因组学中的生理特征,形态差异,进化和代谢分析的研究提供资料,从而为许多真菌物种的群体遗传学提供证据。
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