饲养于动物园中的大熊猫，由于采用一雌多雄和人工授精并行的交配制度，经常带来亲子关系不明确的问题。本文选用21对大熊猫微卫星引物，对北京动物园一只大熊猫幼仔及其母亲、2只疑似父亲和其他无关个体(总记17只大熊猫)进行了PCR扩增和基因组扫描，成功地进行了亲子鉴定。用Cervus2.0分析数据，证明在母子关系已知的情况下，这21个微卫星的总非父排除率完全可以满足亲子鉴定的要求，用于圈养大熊猫的亲子鉴定是十分有效率的。但在母子关系未知的情况下，这21个微卫星不能满足亲子鉴定的要求。对于野生大熊猫，由于母子关系经常未知，所以我们需要数量更多的多态性良好的微卫星来进行亲子鉴定。为了解决采样困难这一问题，我们建立了5个大熊猫皮肤成纤维细胞系，由于细胞系具有传代能力，可以源源不断的提供实验材料，从中可以提取出质量良好的基因组DNA。 利用荧光原位杂交(Fluorescencein-situHybridization，FISH)技术，以大熊猫细菌人工染色体(BAC)DNA作探针，用大熊猫皮肤成纤维细胞制备的中期染色体作杂交标本，并通过与大熊猫G-带模式图比较，对6个大熊猫微卫星进行物理定位，确定了这6个微卫星在染色体上的位置，这6个微卫星均属首次定位。其中，Ame10、Ame24、Ame25定位于3号染色体近着丝粒长臂端一侧，Ame26定位于5号染色体短臂端部，Ame23定位于18号染色体端部，Ame19定位于X号染色体长臂端部。同时，我们摸索出了以大熊猫皮肤成纤维细胞为材料制备中期染色体标本的稳定条件，制备出的中期染色体标本质量良好，为大熊猫微卫星的物理定位打下了良好的基础。