基于自组装细胞芯片从事调控细胞迁移和癌症转移功能基因的大规模筛选研究

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癌症转移是恶性肿瘤的一个重要特征以及癌症病人死亡的主要诱因。在癌症转移过程中,细胞迁移则是基本而必要的一个步骤。为了大规模地系统调研调控细胞迁移和癌症转移的功能基因,我们发明了一个新型的芯片方法——SAMcell(细胞自组装芯片)。由于这一方法的特殊优点,已经被证实其特别适合应用于高通量的功能缺失性筛选。SAMcell的第一个应用实例是筛选了人类基因组miRNA(微小RNA),因为越来越多的miRNA已经被证明可以掌控癌症转移。我们发现了超过20%的miRNA可以调控细胞迁移,包括在不同的细胞类型当中,miRNA调控细胞迁移存在普适性。经过三轮筛选,我们得到了miR-23b。这一分子在人类结直肠癌症样本当中显著低表达,并且可以调控癌症转移的多个层面,包括细胞运动,细胞生长和细胞存活。平行地,SAMcell的第二个应用实例是筛选了人类基因组激酶,因为越来越多的激酶已经成为成功的临床诊断标志或者药物靶点。我们发现了超过11%的激酶可以调控细胞迁移,表明在癌症迁移的调控当中激酶扮演了重要角色。通过功能筛选和生物信息学分析,我们得到并验证了六个潜在的癌症转移调控基因,它们有希望成为治疗癌症的新靶点。这些发现为人们更好地理解人类癌症发生和转移的调控机制提供了新思路,并且有助于人们更好地洞察miRNA和激酶关于癌症的生物学和临床治疗的意义和重要性。
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