【摘 要】
:
芽休眠是多年生温带落叶果树适应季节性气候变化,免于冬季低温伤害的重要生理过程。休眠一般指内休眠,其解除需要积累一定时长的有效低温(需冷量),否则无法恢复正常生长。近年来,全球气候变暖导致一些南方落叶果树产区冬季低温积累不足进而导致产量和品质下降。同时,需冷量能否满足也是果树引种及设施栽培中的关键问题。因此,探究芽内休眠的诱导、维持和解除的调控机制对于果树生产有重要意义。梨是我国的第三大果树,目前梨
【基金项目】
:
国家现代农业产业(梨)技术体系建设专项资金(CARS-28);
论文部分内容阅读
芽休眠是多年生温带落叶果树适应季节性气候变化,免于冬季低温伤害的重要生理过程。休眠一般指内休眠,其解除需要积累一定时长的有效低温(需冷量),否则无法恢复正常生长。近年来,全球气候变暖导致一些南方落叶果树产区冬季低温积累不足进而导致产量和品质下降。同时,需冷量能否满足也是果树引种及设施栽培中的关键问题。因此,探究芽内休眠的诱导、维持和解除的调控机制对于果树生产有重要意义。梨是我国的第三大果树,目前梨芽休眠的分子调控机制初步建立。同时,研究表明表观遗传尤其是组蛋白修饰在需冷量形成和低温积累过程中发挥了重要作用。本研究以‘砀山酥梨’花芽为材料,对梨芽休眠调控的潜在基因进行挖掘并初步探究了H3K4me3组蛋白修饰对梨芽休眠的调控作用,丰富了梨芽休眠调控的理论基础,为后续芽休眠的研究提供候选基因。本研究的主要结果如下:1、梨芽低温积累过程基因表达及H3K4me3修饰水平变化分析对人工低温积累及自然状态的‘砀山酥梨’休眠芽进行转录组测序分析,利用Mfuzz对样本中的基因表达模式进行聚类,筛选到两类样本中表达趋势均与芽休眠过程相符合的差异表达基因共1001个。对人工低温积累样本cluster 2、4、5、9中的差异表达基因的表达模式进一步分析,最终筛选到PpyNAC88、PpyCYC-J18等参与调控休眠的候选基因。结合ChIP-seq对人工低温积累的梨芽样品的H3K4me3组蛋白修饰水平进行全基因组分析,结果显示H3K4me3修饰主要发生在基因的转录起始位点附近,且富集程度与基因转录水平呈正相关关系。对休眠关键基因PpyDAM及候选基因PpyNAC88,PpyCYCJ18的转录水平与H3K4me3修饰富集程度进行分析,结果表明H3K4me3修饰可以通过调控休眠相关基因的转录水平,参与调控芽休眠的维持与解除。2、COMPASS-like复合体成员PpyWDR5a维持梨芽休眠COMPASS-like复合体能够识别并催化下游靶基因发生H3K4me3修饰,在多个物种中具有保守性。本研究鉴定出梨COMPASS-like复合体成员PpyWDR5a在芽休眠过程中的表达与维持梨芽休眠的关键基因PpyABF3和PpyDAMs的表达趋势一致,并通过CoIP实验及亚细胞定位结果证明其能够与另外两个成员PpyASH2R及PpyRBL在细胞核内形成COMPASS-like复合体。在茄梨愈伤组织中过表达PpyWDR5a能够抑制其生长,过表达PpyWDR5a的拟南芥株系种子休眠加深,萌发率显著下降。此外,利用梨芽进行病毒诱导的基因沉默(VIGS)实验,沉默PpyWDR5a之后能够促进梨芽休眠解除。以上结果表明PpyWDR5a在梨芽休眠维持过程中发挥重要作用。3、梨组蛋白赖氨酸甲基转移酶SDG家族鉴定及其在休眠中表达分析COMPASS-like复合体通常需要甲基转移酶协同工作。为了进一步挖掘在梨芽休眠维持过程中与COMPASS-like复合体协作的甲基转移酶,本研究首先鉴定并分析了梨基因组中的SDG家族成员共64个。系统进化分析将SDG家族进一步分为7个亚族且各亚族内成员结构域组成存在一定的保守性。共线性及Ks结果显示,梨全基因组复制事件导致梨SDG基因家族扩张。分析PpySDG基因在人工低温积累及自然状态梨芽样品中的表达模式,筛选到PpySDG13,PpySDG37等13个基因可能与促进休眠解除相关,而包括PpySDG44与PpySDG58在内的部分基因则可能在维持休眠中发挥一定功能。最后利用酵母双杂,筛选到了与PpyWDR5a互作的组蛋白甲基转移酶PpySDG45,其可能参与形成梨COMPASS-like复合体并在H3K4me3修饰对休眠的调控中发挥功能。
其他文献
由核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)引起的菌核病是油料和蔬菜作物最严重的病害之一,作物抗性品种的缺乏阻碍了对菌核病的持久有效控制。抗病调控基因的挖掘为抗病品种的培育提供新途径和基因资源。Ca2+信号在植物各种生物学反应中均发挥重要调控作用。环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated ion channel,CNGC)是一类Ca2+通道,调控Ca2+
发芽和发酵在植物和微生物的生长和繁殖中有重要作用。籽粒发芽或发酵能改变淀粉的理化特性。红曲在我国历史悠久,是由红曲霉菌丝寄生在大米上而来,具有降脂功效。发酵过程中微生物消耗能源物质,并通过生理活动改变稻米中的营养物质含量。水稻发芽过程中亦会产生大量生物活性成份。发芽糙米(Germinated brown rice,GBR)被认为是一种天然功能性食品,具有较高营养价值。利用GBR进行红曲发酵可能会进
西番莲在栽培过程中极容易感染植物病毒。在感染西番莲的病毒中,Potyvirus属的夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,Tel MV)和东亚西番莲病毒(East Asian passiflora virus,EAPV)是危害西番莲最重要的两种病毒,严重威胁我国西番莲产业的健康发展。最近新发现的西番莲重型斑驳相关病毒(Passionflower severe mottle-ass
错配修复(Mismatch Repair,MMR)系统是一种重要的DNA损伤修复途径,其主要作用是识别与修复DNA合成、遗传重组及损伤过程中产生的单个及少数碱基的缺失、插入及错配。因此,MMR的功能对保持基因组完整性、稳定性以及DNA复制的忠实性至关重要。MSH6蛋白是植物错配修复系统的重要一员,OsMSH6是水稻中已鉴定的与拟南芥At MSH6同源的错配修复基因,但目前为止,对它的功能还缺乏深入
镉(Cadmium,Cd)是农田生态系统中最普遍、毒性强的重金属污染物之一。土壤中二价的镉离子被作物根吸收,并转运分配至可食用部分和种子,严重影响作物生长发育、产量和食用安全。在这些生理过程中,根吸收是镉进入植物细胞的第一步。大麦(Hordeum vulgare)是全球第四大禾谷类作物,其籽粒集食用、饲用和啤酒原料等用途于一身。由于其生态适应性强,耐贫瘠,且能在不同土壤条件下种植,受土壤镉污染潜在
淀粉是小麦的主要成分,对小麦的结构和功能特性有重要影响。虽然淀粉中结合蛋白含量极低,但是越来越多的研究表明淀粉颗粒结合蛋白的存在能显著影响淀粉颗粒的理化性质。本研究系统分析了冻融、去除淀粉颗粒结合蛋白SGAPs(包括淀粉颗粒表面蛋白SGSPs和淀粉颗粒通道蛋白SGCPs)和复合处理对不同直链淀粉含量的小麦淀粉理化性质的影响,去除SGSPs对小麦A型淀粉(AS)和B型淀粉(BS)理化特性及α-淀粉酶
棉花是世界上重要的商业纤维作物之一,为纺织工业提供天然纤维原料。陆地棉(Gossypium hirsutum)是主要的四倍体栽培棉种,具有适应性强、产量高的优势,占世界棉花总产量的90%。解析陆地棉农艺性状形成的遗传基础,鉴定重要农艺性状关联位点并发掘优异基因是棉花精准育种的重要途径。短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)一般由串联重复的1-6个核苷酸组成,是分子育种中广
环状RNA是一类普遍存在于动、植物界的内源性共价闭合单链RNA分子,是非编码RNA家族中的一员,由前体mRNA的反向剪接产生。伴随测序技术和分析手段的革新,日益深入的研究已在动物中发现了大量功能特异的保守环状RNA,但在植物界相关报道还很少,且几乎没有系统地研究植物环状RNA保守性及其进化关系的工作。本论文利用自主测序产生的稻属物种及玉米、小麦的转录组数据11份,结合422份公开发表的14种植物转
柑橘果皮油胞中积累了大量的挥发性成分,包括单萜烯,倍半萜烯及其含氧衍生物,以及脂肪醇类,醛类等。这些物质往往具有抗真菌活性,在果蔬保鲜领域有潜在的开发应用前景。本研究对比了柑橘发病前后含量变化明显的挥发性成分对果蔬采后病原真菌的抑制活性,筛选出具有强抑菌活性的化合物,探究其抑菌机理,并研发了相关的稳态化技术。主要结果如下:1.利用果实体内接种法评估了12种挥发性化合物对于苹果灰霉病的防治效果并进行
随着第四次工业革命的到来,仓储行业由过去的静态仓储模式转变为如今的动态仓储模式,传统仓储行业为了降本增效,加强在市场上的竞争力就需要向智能化、科学化、系统化的云仓模式迈进,使用大数据、物联网等现代信息技术和精益化的管理方式来改变传统仓库的运营模式。为提升仓储公司的效益需依托现代信息技术,应用现代化的云仓储管理思想。因此云仓储管理在仓储公司的经营管理中起着至关重要的地位。鉴于以上背景,本文章以ZS云