近年来,由于国内市场需求增加以及国家政策的扶持,我国的兵团农机合作社在最近几年得到了突飞猛进的发展,从而促进了兵团农业和机械化的推广和普及,加快了我国农业机械化和兵团化的进程。在兵团农机合作社迅速发展,给农机合作社的社员带来收入增加的同时,我们也要看到农机合作社发展过程中暴露的问题和不足,比如兵团团场小而散的特点,农机合作社也呈现小而散的状态,不能形成规模化效应,相关专业人才引不来、留不住,农闲时间造成了人力、物力的闲置和浪费,农机合作社效益不高等。因此,在农机合作社存在以上这么多问题和不足的现状下,如何促进问题和不足标准化、规范化和科学化发展,助力农机合作社提质增效,是我们急需解决的一个难题。本文在研究国内外学者在该领域研究成果的基础上,结合合作经济理论、委托代理理论、机制设计理论,采用发放问卷调查的方式,以可克达拉农机服务合作社为例,查找该合作社存在的问题,并分析原因。通过调查研究发现,可克达拉农机服务合作社目前主要存在股权控制不清晰、很多农业机械闲置时间长、社员文化水平低,决策能力差、利益分配不合理、因管理机构不健全,管理制度不规范、风险防范机制不完善、监督存在漏洞、调度难度大等问题。在此基础上,参照法国和安徽省农机合作社先进的经验和做法,针对可克达拉农机服务合作社现存的问题,提出要从完善管理机制、明细股权设置、规范决策机制、建立健全监督机制、建立科学合理的利益分配机制、完善服务经营机制等方面,优化可克达拉农机服务农民专业合作社经营模式。本文以可克达拉农机服务农民专业合作社作为研究案例,旨在通过对农机专业合作社现状和运行机制进行剖析,找出农机合作社发展过程中运行机制存在的问题,并对存在的问题提出的解决措施,这对加强农民专业合作社运行机制理论研究有借鉴作用。