光质调控黄瓜花性分化的转录组分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:foxdeng
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黄瓜是世界上设施栽培面积最大的蔬菜种类之一,也是我国设施园艺栽培的第一大蔬菜作物,在蔬菜产业中地位十分重要,调控黄瓜的花性分化具有重要的经济意义。光环境是实现温室作物高产优质的首要条件。本研究主要以“华青5号”黄瓜(Cucumis sativus L)为试材,研究不同光质4R1B、2R1B处理黄瓜幼苗,观察统计黄瓜移栽后在温室大棚中的雌花开花情况,并通过RNA-seq技术分析比较不同光质处理黄瓜幼苗转录本的转录组数据,发掘光质调控黄瓜苗期花性分化和开花时间相关的基因。得以下结果:1、黄瓜苗期不同光质处理影响黄瓜第一朵雌花开放节位、15节以内雌花数、第一朵雌花开花的时间,结果表明:与R4B1处理相比,R2B1处理黄瓜第一朵雌花开放的节位显著降低,15节以内雌花总数显著增加,第一朵雌花开放的时间显著提早,说明苗期较高蓝光比例R2B1处理,可以增加黄瓜雌花数、提早开花时间。2、RNA-seq发掘光质调控黄瓜苗期花性分化和开花时间相关的差异表达基因,结果表明:(1)光质处理R2B1三个时期总的特异差异表达基因数远远多于R4B1光质处理,R4B1-down特异差异表达基因有255个,R2B1-down特异差异表达基因有2623个;R4B1-up特异差异表达基因有440个,R2B1-up特异差异表达基因则有4308个。(2)R4B1、R2B1处理上、下调特异差异表基因pathway富集分析显示,被注释到最多的通路是激素信号转导途径。(3)激素信号转导通路进一步分析发现,生长素相关的差异表达基因在激素信号转导通路中所占的百分比最大,其次是CTK、ABA、ETH、BR、JA和SR,但GA在激素信号转导途径中没有差异表达,表明了光质调控黄瓜苗期花性分化过程中IAA可能起着关键的影响。(4)AGL和SOC1都属于MADS-box基因,可以调控植物开花时间,在黄瓜茎尖中鉴定到2个SOC1的同源基因和1个AGL的差异表达基因AGL19,它们在R2B1、R4B1处理茎尖中,有着相同的表达模式,在R2B1-5、R4B1-5、R4B1-10中均下调表达,在R2B1-10、R2B1-15中上调表达,其中在R2B1-10中表达最高。(5)转录因子分析发现,bHLH转录因子与光信号转导、激素信号转导和开花有关,在转录本中共鉴定到7个差异表达的bHLH转录因子,其中有6个在R2B1-10上调表达,1个下调表达;光敏色素互作因子PIFs,可以直接与光敏色素的活化形式相互作用开始光信号转导,属于bHLH家族成员,它在R4B1-10表达量开始增加,而在R2B1-10表达下调;WKRY转录因子参与多种代谢途径,在转录本中鉴定到6个差异表达家族基因成员,其中有3个在R2B1-10中上调表达,2个在R2B1-10中下调表达,但它们在R4B1中又都上调表达,1个WRKY转录因子在R2B1和R4B1中有着相同的表达模式;MYB转录因子与植物激素和花器官发育有关,在转录本中鉴定到9个差异表达基因,其中有2个新基因。这9个差异表达基因有7个在R2B1-10中上调表达,只有两个在R2B1-10中下调表达。3、不同光质处理黄瓜苗期叶片中红蓝光受体及开花相关基因的表达分析,结果表明:(1)光质处理黄瓜苗期第10d,在较高蓝光处理R2B1叶片中的蓝光受体CRY1显著高于较低蓝光处理R4B1,但没有检测到蓝光另一个受体CRY2。(2)在黄瓜叶片中共检测到4个红光受体基因:PHYA、PHYB、PHYC、PHYE,在光质处理第15d时,较低蓝光比例R4B1的PHYA显著高于R2B1,而其余三个红光受体PHYB、PHYC、PHYE都是在光质处理10d时,R4B1显著高于R2B1。(3)光质处理黄瓜苗期第15d,在R4B1处理叶片中的CO表达量显著高于R2B1。(4)光质处理黄瓜苗期第10d、15d,在较高蓝光处理R2B1叶片中的FT表达量显著高于较低蓝光处理R4B1,这说明适当的红蓝光质配比可能通过CRY1、PHYA、PHYB、PHYC、PHYE调控黄瓜叶片中CO、FT的表达,从而调控黄瓜开花。因此,较高蓝光比例R2B1处理黄瓜苗期可能从茎尖激素信号转导途径、转录因子方面调控黄瓜苗期花性分化过程,从而增加黄瓜雌花数,此外,较高蓝光比例处理通过叶片光受体感应到光信号,调控叶片中的CO、FT基因的表达,进而调控茎尖MADS-box基因AGL和SOC1基因,从而促使雌花花芽较早出现、提早开花。
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