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望天树(Parashorea chinensis Wang Hsie.)又名擎天树,生长在我国热带雨林中,是我国首要的珍稀濒危保护植物,目前对望天树遗传多样性和种质资源保的研究尚浅。本研究通过对望天树不同家系幼苗的生长差异、生理差异以及遗传多样性特征的分析,旨在探明其遗传变异产生的原因,初步筛选出望天树优良家系,为优良种质资源发掘、良种选育、濒危树种资源的保护人工林发展奠定基础。对分布在广西和云南的15个望天树家系二年生幼苗采用随机重复取样测量子代幼苗的苗高、地径、叶面积及生物量,内源激素ABA、GA3、ZR和IAA含量,叶绿素a、b的含量,叶片最大净光合速率Pn、气孔导度Gs、胞间C02浓度Ci、最大蒸腾速率Tr、最大原初光能捕获效率Fv’/Fm’、光化学淬灭系数qP和非光化学淬灭系数NPQ等光合参数,ISSR-PCR标记法研究望天树不同家系多态位点、有效等位基因数、Shannon指数和Nei指数。结果表明:(1)二年生苗木苗高的变异系数为9.37%,家系遗传力为0.781,说明遗传对苗高有较大程度的控制作用。家系平均苗高为20.27cm,其中最高的是那坡03(23.50cm),为平均值的113.70%,最低的家系是勐腊03(17.80cm),仅为平均值的87.81%;地径变异系数为11.35%,家系遗传力为0.768,最优的是那坡03(4.64mm),达到了家系平均值的117.60%,最差的家系是勐腊03(3.40mm),为家系平均值的84.79%;叶面积变异系数为13.84%,家系遗传力为0.727,最大的是那坡03(29.00cm2),是家系平均值的170.28%,最小的是勐腊03(10.56cm2),为平均值的62.01%;鲜重和干重平均生物量最大的均是那坡02,鲜重为2.80g,干重为0.90g。鲜重和干重平均生物量最小的均是河口 02,鲜重为1.65g,干重为0.26g。(2)内源激素的含量差异:ABA含量河口 03最高为54.50ng/g,马关01含量最低为30.03 ng/g。GA3含量那坡03最高为11.59 ng/g,勐腊03最低为3.55ng/g。ZR含量那坡03最高为12.57ng/g,勐腊03最低为6.16ng/g。IAA含量那坡03含量最高为74.25 ng/g,勐腊03含量最低为34.15 ng/g。(3)光合指标的差异:那坡03Pn值最大为48.73μmol·m-2·s-1,勐腊01的最小为 23.46 μmol·m-2·s-1;河口 02 Ci最大为 358.73 μmol/mol,勐腊 01 的最低为310.76μmol/mol;那坡03的Gs值最高为0.47mol·m-2·s-1,勐腊01的最低为0.23 mol·m-2·s-1;那坡04的Tr值最大为0.57 mmol/m2·s,勐腊01的最低为0.51mmol/m2·s。田阳01Fv’/Fm’值最高为0.27,马关02的最低为0.16;那坡03qP值最高为0.44,田阳01的最低为0.15;马关02的NPQ值最高为0.83,那坡01的最低为0.42。叶绿素a的含量,那坡03最高为0.81,勐腊04的最低为0.26;叶绿素b的含量与叶绿素a的含量差异相同。(4)遗传多样性,15个家系的多态位点分布在8.13%-26.85%范围内,其中最高的是那坡03(26.85%),最低的是勐腊03(8.13%),家系的平均多态位点百分比为16.58%,遗传分化分析结果显示群体之间总的遗传变异占有62.64%,群体内的变异仅有37.36%,种源间的遗传变异占有很大的比例,基因流系数也远小于1,说明家系之间存在明显的分化,聚类分析树状图表明15个家系被分成遗传距离不等的五个组,其中那坡03多态位点百分率较高,适应环境能力最强,可作为优势种源进行培育,勐腊03适应性最差。总体上,那坡03、河口 03、那坡02的幼苗呈现出较大的优势,其中那坡03最为优秀,生长指标、生理指标及遗传稳定性较高。而勐腊03的幼苗综合指标表现较差,且遗传稳定性不高,不利于育苗培育。因此可以将那坡03作为最为优良家系的苗期选择。