基于概率模型的长非编码RNA-疾病关联关系预测方法研究

来源 :湘潭大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:birdlay
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近年来,关于lncRNA-疾病的关联关系预测研究一直富有一定的研究价值。大量的研究说明了,lncRNA在生物学进程,复杂疾病的诊治,判断,预后以及临床中起着关键性的作用。考虑到生物学实验证实的lncRNA-疾病的关联关系仍然有限,因此,为了解决已知的lncRNA-疾病相关性稀疏的问题,开发有效的计算模型来发掘潜在的lncRNA-疾病相关性是非常重要的。利用生物信息学方法发掘疾病关联lncRNA是目前的一个研究热点,并备受研究者们广泛的关注。本文首先介绍疾病关联lncRNA的背景知识,然后着重介绍通过两种方法来预测lncRNA-疾病的潜在关联关系,具体的研究方法如下:(1)近年来,通过整合多种多样的生物学数据来建立一个计算模型来预测lncRNA-疾病之间的潜在关联关系已经成为生物学研究的热点。第三章首先通过整合多种生物学信息构建了一个全局三分网络,这些信息包括miRNA-疾病、miRNA-lncRNA以及lncRNA-疾病之间关联关系和相互作用。然后,将基因-lncRNA、基因-疾病和基因-miRNA相互作用网络添加到已经构建三分网络中,进而构建了一个全局四分网络。接下来,基于这两个全局网络,提出了一种基于朴素贝叶斯分类器的模型来预测lncRNA-疾病潜在关联关系。该方法不完全依赖于已知的lncRNA-疾病的关联,并且通过实验,表明了该方法的高效性。(2)基于朴素贝叶斯分类器和协同过滤算法,构建一种新的预测模型来预测lncRNA-疾病的潜在关联关系。首先通过整合miRNA-lncRNA、miRNA-疾病以及lncRNA-疾病的关联关系和相互作用来构建一个lncRNA-miRNA-疾病的原始三分网络,然后通过将协同过滤算法添加到三分网络中,从而构建一个更新后的三分网络。接下来,基于更新后的三分网络,将朴素贝叶斯分类器应用其中来预测lncRNA-疾病的潜在关联关系。该方法在已知的lncRNA-疾病关联关系稀疏的情况下,可以获得良好的性能。本文最后一章是对上述两种预测模型的总结,并讨论了下一步的研究计划。
其他文献
随着IT产业的快速发展,行业内的竞争也在不断的加剧,这对于电子连接器来说既是一个机会,又是一个挑战。这种竞争集中体现在产品的品质和价格上,要想有竞争力,既要价廉又要物
目的:通过研究比较不同种质和表型的当归与地方习用品东当归、牡丹叶当归的差异,建立当归与东当归、牡丹叶当归之间的分子鉴别。方法:对14个不同种质和表型的当归及其地方习
长爪沙鼠疫源地是我国10型鼠疫自然疫源地中比较活跃的一块疫源地,鼠疫动物病常有发生,也有人间鼠疫的散发与流行.根据国内近年来有关资料,阐述了长爪沙鼠疫源地的分布、发现
综合运输货运量指标作为交通运输中最重要的组成部分,是判断宏观经济的变化的重要参考依据,是反映宏观经济变化的晴雨表,对社会经济的发展起着举足轻重的作用。研究综合运输货运量与国民经济之间的关联关系分析,目的在于探索并发现综合运输货运量与国民经济之间的内在联系和识别综合运输货运量与经济发展关系的影响因素,能够更好地服务于交通运输经济运行分析,并为宏观决策提供重要支撑。本论文是在国内外理论研究和实证研究的
由于历史原因,A商业银行四川省分行在网点布局、自助渠道布局、线上银行业务发展、渠道整合等诸多方面存在问题,导致与先进同业在客户基础、资产规模存在短板,再加上互联网化
社会发展对应用型和技能型人才的需求变大,相应地,各高校将培养更多的复合型人才作为主要目标。对独立学院来说,在实际教学中主要存在不重视实践教学的情况,部分学生还认识不
客户是企业最为宝贵的无形资产,面对席卷全球的金融危机带来的巨大影响,苏州市软件评测中心有限公司作为苏州软件园的平台服务单位,担负着扶持中小软件企业发展、帮助传统软
目的:探讨不同孕期甲型流感采用奥司他韦治疗后对妊娠结局的影响。方法:将2013年1月~2018年6月在我院接受检查和治疗,并在我院生产的71例孕妇作为临床分析资料,将其分为四组,
鼠疫是由鼠疫杆菌引起的。通过跳蚤传播,流行在啮齿动物中间的自然疫源性疾病。动物间不同类型的鼠疫,具有特定的地区、宿主、媒介、流行和保存的规律。并在一定条件下通过染病
为利用密度泛函理论的第一性原理研究压强对WTe2的电子结构及光学性质的影响,本文首先利用全电势局域轨道最小基能带结构方案研究了1.22 GPa、2.4 GPa和13.0 GPa下的WTe2的能