随着我国经济体制转轨的逐步完成,计划经济体制也将随之消亡。但在烟草行业,专卖制度作为保留计划经济体制特点最为浓厚的一项经济制度,却依然以合法的形式存在。诚然,烟草消费带来的高昂的社会成本,这一点从经济学的角度说明了烟草消费的不科学性,同时它也是世界各国实行烟草规制的主要原因,乃是我国实行烟草专卖制度的理论基础。但在当前我国的烟草专卖制度下,对烟草行业实行的税收政策、分配机制以及行政权利关系等影响着地方政府分割规制、地方保护等诸多短期和“局部”行为,从而衍生了诸如地区垄断、价格混乱、体外循环和品牌集中度低等问题,从而使得烟草生产和销售效率低下,制约了烟草行业的发展空间,给社会造成更大的浪费的同时,使我国的烟草企业没有能力应对WTO规则以及经济全球化的挑战。因此,对中国烟草专卖制度下中央与地方利益关系的研究,分析其中体现出的中央与地方政府利益博弈问题和原因,对于构建和谐的中央与地方关系具有一定的参考价值和现实意义。本文从对政府规制理论和博弈论的阐释出发,结合当前我国政府规制下烟草行业发展现状,分析我国烟草专卖制度下中央与地方政府间的利益冲突。在此基础上,通过构建博弈模型来说明中央与地方政府间利益博弈的症结。并从我国烟草产业整合中的制度缺失、财税体制不合理、烟草管理体制内在缺陷、烟草专卖地方立法为地方专卖提供合法依据四个层面分析其利益冲突的原因。最后,在借鉴发达国家在烟草行业发展过程中处理中央与地方利益关系的经验基础上,对完善我国烟草行业中的中央与地方政府利益关系提出对策建议。