番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus, ToCV)和番茄黄曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)，均主要通过烟粉虱(Bemisia tabaci)进行传播扩散危害。随着烟粉虱在我国的快速传播，ToCV和TYLCV在我国主要茄科产区快速扩散危害，且存在ToCV和TYLCV复合侵染，番茄的症状更严重，给番茄等重要茄科经济作物造成严重的经济损失。开展ToCV和TYLCV在我国主要茄科产区的分布、复合侵染率及其分子遗传变异研究，可为明确ToCV和TYLCV对我国番茄的潜在威胁提供科学依据，也可为明确ToCV和TYLCV适应性进化提供理论依据。
　　2017~2019年，从我国内蒙古、河北、山东、甘肃、山西、河南、安徽、上海、江苏、贵州、云南、广西和海南等十余个省(市)番茄主产区，采集疑似ToCV和(或)TYLCV侵染的番茄样品625份，利用ToCV特异性RT-PCR检测，ToCV检出率为28.48%，其中广西省ToCV检出率最高，达到91.36%；ToCVCP基因序列分析表明，我国ToCVCP基因序列相似性大于99%，与土耳其分离物相似性仅为96.25%。系统发育分析表明，ToCV在传播扩散过程中，已经出现一定程度的分子变异，然而其分子变异不存在地域依赖性。
　　178份感染ToCV番茄样本中，采用RT-PCR和常规Sanger测序，获得27个ToCV分离物的基因组全序列。ToCV全基因组分RNA1同源性测定的我国13个省份的ToCV的27个分离物，RNA1的相似性大于99%；与北京、江苏和韩国ToCV分离物存在一定的差异。ToCV基因组RNA2相似性大于98%，分离物之间存在一定遗传分化，具有一定的地域依赖性。碱基替换和中性分析表明，基因组分RNA2，其序列核苷酸的替换比率，高于基因组分RNA1。
　　采集的625份番茄叶片中，TYLCV检出率为74.88%，其中，江苏番茄TYLCV检出率最高，达到100%，山西番茄TYLCV检出率最低，为18.75%。番茄对ToCV与TYLCV的平均复合侵染率为20.00%，其中，河南番茄复合侵染率最高，达到46.67%，云南番茄复合侵染率最低，为5.06%。测定TYLCV的序列相似性高达99.32%，没有明显的分子变异。