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棉花产量的在线监测过程中，采样点成千上万，要对这些采样点的数据进行实时存储，仅仅依赖于单片机上的存储单元是远远不够的。基于单片机的棉花质量流量在线测量现场设备，没有操作系统支持数据以文件的形式存入外部存储设备。本文通过FatFs文件系统在LM3S5749片上的移植，实现了对SD卡的读写访问及存储操作，从而可靠有效的解决了现场数据存储不足在测产系统中的问题。