1.营养土准备不当 一是使用干陈砖土、干火土灰等作为营养土，这是引起死苗的较为普遍的一个原因。因为陈砖土中含有大量硝酸钾的可溶性盐类，它们未经淋洗，加上做旱育秧的旱地没有足够的水分来稀释，容易出现营养土盐分浓度过高而导致秧苗反渗透失水。干火土灰和草木灰如果未经水淋洗，会含有大量的硝酸钾（弱酸强碱形成的盐类）等呈碱性反应的盐分，导致碱性过大（pH值在7以上），给立枯病菌创造了适宜的侵染环境条件，易引起生理性立枯病死苗；同时盐分浓度过大也易造成烧苗。二是使用未经腐熟的农家肥或单质化肥也容易导致死苗。因此，旱育秧苗床土壤一般不用陈砖土、火土灰、草木灰做营养土，不施未经腐熟的农家肥和单质化肥。如果用了，应马上灌一次跑马水或淋水冲洗，并注意加强立枯病的防治。
　　2.施肥不当 一是底肥不均匀，肥土未融合、有机肥未腐熟，下扎秧根容易接触肥团或肥塘被烧伤，导致地上部分生理失水死苗。二是施用化学肥料做种肥时，没有很好地翻沤，化学肥料分布不均匀，导致旱育秧的胚根触肥被烧焦，使幼苗有芽无根成片枯死。三是追施化肥时浓度过大，或施用后不及时淋清水，或直接撒施而造成烧伤死苗。特别是施用了尿素时，若不及时淋水，尿素中所含的缩二脲以及转化而成的氨气易导致中毒，会引起秧苗成片或带状死苗。
　　3.播种过早，低温引起冻害诱发病害 早稻旱育秧如果播种过早，在2～3叶时遇到强寒潮袭击，就会出现冻伤，同时诱发立枯病、绵腐病大量发生，造成严重死苗。
　　4.苗床不平，软盘悬空死苗 有的地方在整理旱育秧苗床时耕作粗放，苗床床面高低不平，软盘不在同一平面上，一些低凹处出现钵体悬空，营养土与苗床水分隔断，太阳一晒便会出现死苗。因此，在整理旱育秧苗床时，整地要细，苗床同处一水平面上，并用泥巴做隔离层。
　　5.浇水不当 早稻种子发芽和幼苗生长特别需要充足的水分，塑料薄膜覆盖又易造成表土层水分不足。因此，早稻旱育秧3叶期前要每隔5天左右浇1次水，保持床土水分充足。值得注意的是，有的农户在中午揭膜后马上浇水，甚至有的用井水为膜内温度过高的秧苗降温，这种情况最易造成旱育秧出现青枯死苗；苗床水分管理时应该做到合理揭膜，有的农户缺乏随膜内温度高低随时揭盖膜加以调控的经验，以致造成膜内温度过高而烧死苗；或育秧时笼罩薄膜的框架过低，或日平均气温过高时未遮阳降温，而造成烧苗死苗。
　　6.出苗后施化肥不当 旱育秧苗出苗后，施入的化肥没有足够的水分去稀释，因浓度过大而导致死苗。因此，苗床期一般不追肥，解决秧苗缺肥主要靠培肥营养土（取生黄土20千克、充分腐熟畜禽粪渣10千克、冬耕晒垡并过筛的稻田土30～50千克、复合肥1千克，充分拌匀保湿堆沤15～20天，临播时晒干即成营养土）。一般每亩大田备营养土65～80千克。如果秧苗生长期错追了化肥，可用水冲洗，以防死苗。
　　7.干枯死苗 这种情况主要发生在苗床培肥达不到标准，苗床板结，苗床耕层太浅，土壤保墒性能差，根系不能下扎利用深层土壤的水分维持生长，遇到烈日高温天气；或播种量过大，单株根系分布范围变小，加之密播情况下单位面积土壤供水负荷加重，供需矛盾突出时，死苗现象就会更加突出。所以，旱育秧苗床的培肥，一定要落实到位，以利培育壮秧。在旱育秧苗生长期间，如果出现暴晴天气，苗床中央易出现温度高于40℃而死苗的現象，因此，晴天要注意调温降温，并注意防止营养土发白脱水，如营养土发白要结合揭膜通风降温、淋水抗旱；否则秧苗容易失水，出现大量死苗。
　　8.病害死苗 主要是立枯病、绵腐病和其他霉菌引起的死苗，以及由低温引起的缺素死苗。旱育秧苗床播种前要用800倍敌磺钠药液进行苗床土壤消毒，床土消毒前要浇透水。1、2、3叶期分别喷洒1000倍敌磺钠药液预防病害。持续低温期间如出现黄叶，可叶面喷施0.2%硫酸亚铁溶液补充铁元素。防止苗床病害，应注意因盲目早播而诱发立枯病等低温病害。膜内温度过高容易造成青枯死苗，特别是突然变晴后，因土壤温度低和根系受伤而吸水不足，气温骤升后因大量蒸腾失水而造成生理死苗。因此，一定要注意揭膜通风降温，注意浇水保湿。暴晴时注意用稻草盖膜遮阴降温，炼苗后再撤膜。