【摘 要】
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目的 探讨灯盏乙素治疗心脑血管疾病以及抗病毒的分子机制.方法 利用Pharm Mapper数据库计算灯盏乙素在人体内的作用靶点;以R语言为工具,使用基因本体论数据库(GO)和京都基因
【机 构】
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中山大学公共卫生学院(深圳),广东广州510006
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目的 探讨灯盏乙素治疗心脑血管疾病以及抗病毒的分子机制.方法 利用Pharm Mapper数据库计算灯盏乙素在人体内的作用靶点;以R语言为工具,使用基因本体论数据库(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)探讨灯盏乙素的作用通路;通过String数据库预测蛋白与蛋白之间的作用关系;通过Cytoscape软件(3.7.2)将灯盏乙素-靶点以及靶点-靶点之间的相互作用关系可视化,使用分子对接的方法明确灯盏乙素与其核心靶点AKT1结合的关键氨基酸.结果 通过生物信息学分析发现灯盏乙素在体内的作用靶点有300个,其主要是通过丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K/Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路、Ras信号通路、叉头转录因子(FoxO)通路发挥作用;进一步分析得到了27个关键靶点,主要包括AKT1、SRC、PTPN 11、HSP90AA1、ESR1、RHOA等;分子对接结果显示灯盏乙素与其核心靶点AKT1结合的关键氨基酸分别是295位亮氨酸(LEU295),293位苯丙氨酸(PHE293),279位天冬酰胺(ASN279).结论 AKT1是灯盏乙素作用的核心靶点,其相互作用的关键氨基酸有潜力作为药物设计的靶点.
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