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采用分子动力学和MM/PBSA相结合的方法预测了表皮生长因子受体和4-苯胺喹唑啉类抑制剂的相互作用模式.在分子动力学采样的基础上,采用MM/PBSA的方法分别预测了四种可能结合模式下表皮生长因子受体和4-苯胺喹唑啉类抑制剂间的结合自由能.在MM/PBSA计算中,受体和抑制剂之间的非键相互作用能采用分子力学(MM)的方法得到;溶剂效应中极性部分对自由能的贡献通过解Possion-Boltzmanne(PB)方程的方法得到;溶液效应中非极性部分对自由能的贡献则通过分子表面积计算(SA)的方法得到.计算表明,在