目的:对比观察全飞秒小切口基质透镜取出术(SMILE)与飞秒LASIK术后两年角膜基底膜下神经纤维、角膜基质细胞、角膜切削面、角膜切口愈合的改变。方法:前瞻性、非随机对照研究,连续收集2010年6月至2012年3月接受SMILE或飞秒LASIK的患者。分别在术前,术后1周,1、3和6个月、5年利用角膜共聚焦显微镜测量角膜中央区、帽缘和瓣缘的角膜基底膜下神经纤维、角膜基质,角膜帽、角膜瓣缘切口改变。术后半年的结果已经发表报道,本研究仅报告术后5年的观察结果。结果:术后5年时SMILE组、飞秒LASIK组角膜中央区均可见再生的、粗大的、有分支角膜基底膜下神经纤维。与术前比较,神经纤维形态较扭曲。SMILE、飞秒LASIK术后角膜切削面仅可见少量的高反光样颗粒状物质,伴有轻度的纤维增殖反应,切削面角膜基质细胞数量减少。SMILE、飞秒LASIK术后角膜切口均可见上皮栓,伴切口纤维性愈合。结论:SMILE、飞秒LASIK术后5年,角膜基底膜下可见再生的、粗大的、有分支角膜基底膜下神经纤维。切削界面见少量的高反光样颗粒状物质,伴有轻度的纤维增殖反应,切削面角膜基质细胞数量减少。