硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异microRNA筛选与生物信息学分析

来源 :中国临床药理学与治疗学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bosswhy
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目的:筛选硝酸甘油耐受大鼠主动脉差异表达的microRNA (miRNA),并分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法:SD大鼠皮下注射给予硝酸甘油连续3 d造成硝酸甘油耐受模型,胸主动脉提取RNA后,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA,并用qRT-PCR进行验证。利用生物信息学方法预测差异表达miRNA调控的靶基因,分析靶基因富集的基因功能(gene ontology,GO)和信号通路(pathway)。结果:与对照组比较,硝酸甘油耐受组共有28个miRNA表达发生显著变化,其中16个为已知miRNA,其中12个上调,4个下调(P <0. 05)。qRT-PCR检测了miR-487b-3p和miR-503-5p,变化趋势与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异miRNA的靶基因主要富集于蛋白结合和代谢途径。结论:硝酸甘油耐受大鼠主动脉miRNA表达明显变化,这些差异miRNA通过调控靶基因参与硝酸甘油耐受发生。
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