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分子逻辑门是DNA计算机的重要单元，也是实现运算法则的基本条件。文章以DNA自组装模型为基础，构造了特殊的环状DNA序列。通过将分子信标作为输入信号，或者对输入信号进行相应的标记，实现了与非门、或非门和异或门3种常见复合逻辑门的构造。在结果读取中，用检测荧光强度的方法来判断逻辑真值。反应后溶液中有荧光出现时，表示逻辑值为1；反应溶液中没有荧光出现时，表示逻辑值为0。在整个实验过程中，只需要对DNA序列进行相应的设计，可减少因为反应复杂、反应步骤繁多引起的误差。该模型操作简单，灵敏度高，为分子逻辑计算的实现