【摘 要】
：
目的通过生物信息学分析探讨联合应用利巴韦林和干扰素-α防治中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）感染的分子机制。方法在Array Express数据库中查找MERS-CoV相关的基因芯片数据，利用Agilent GeneSpring GX软件对芯片数据进行处理分析。在比较毒理基因组学数据库（CTD）中查找利巴韦林和干扰素-α作用于人体的靶基因位点，利用PANTHER TOOL和DAVID平台分
【机 构】
：
100013 北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所,100013 北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所,
论文部分内容阅读
目的通过生物信息学分析探讨联合应用利巴韦林和干扰素-α防治中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）感染的分子机制。
方法在Array Express数据库中查找MERS-CoV相关的基因芯片数据，利用Agilent GeneSpring GX软件对芯片数据进行处理分析。在比较毒理基因组学数据库（CTD）中查找利巴韦林和干扰素-α作用于人体的靶基因位点，利用PANTHER TOOL和DAVID平台分别对基因芯片数据和药物靶基因进行GO功能注释和信号通路分析。
结果检索数据库得到MERS-CoV感染相关的mRNA表达谱芯片数据，以及27个利巴韦林和干扰素-α作用的靶基因。对MERS-CoV感染相关mRNA表达谱数据进行聚类分析可分为两组基因群，即基因表达随病毒感染时间逐渐上升或下降。GO分析显示，药物靶基因与基因芯片数据共同涉及10个生物学过程，主要包括细胞生理、代谢、免疫、生物调节、应激反应等。药物靶基因、基因芯片第一组基因群（随病毒感染时间表达上升）和第二组基因群（随病毒感染时间表达下降）参与的信号通路分别为9、3和23个，其中仅前二者有共同参与的信号通路共7个，主要与识别病原体、促进细胞因子释放、生成自身免疫应答等有关。
结论利巴韦林和干扰素-α联合应用可通过干预多个信号通路中的位点起到治疗MERS-CoV感染的作用，MERS-CoV感染相关基因芯片数据中随感染时间表达水平下降的基因可作为药物靶基因为筛选治疗MERS感染的新型药物提供参考信息。
其他文献
目的分析2005-2014年盐城市沿海滩涂恙虫病的时空分布特征，并对气象、鼠类种群分布及生物学特点等影响因素进行相关性研究。方法收集整理2005-2014年盐城市沿海滩涂地区恙虫病疫情、人口学以及气象学资料，并于2011年4月至2013年12月监测该地区鼠类种群分布及其密度、季节消长情况。采用Excel 2003、SPSS 16.0、MapInfo 11.0、Satscan 9.0和Stata/S
目的调查2014年云南省德宏州未经抗病毒治疗的HIV感染者的耐药株传播水平。方法2014年1-8月在德宏州收集70份新报告的16~ 25岁HIV-1感染者的血浆样品，对符合耐药警戒线调查要求的58份样品进行HIV-1基因型耐药检测和耐药株传播水平分析。结果50份样品完成了基因型及耐药鉴定，中国籍占34.0%，缅甸籍占66.0%。通过进化分析对pol区进行分型，主要的基因型包括CRF01_AE、C亚
目的通过Meta分析了解我国医院发现的社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（CA-MRSA）的分子生物学特征和流行病学现状。方法系统检索2015年12月3日前收录于中国知网（CNKI ）、万方数据库、PubMed和Web of Science核心合集的期刊或学位论文，遵照PRISMA规范进行Meta分析，利用Stata 13.0软件对医院发现的CA-MRSA检出率、杀白细胞素基因（PVL）基因携带率
目的对中国现阶段是否应将婴幼儿接种轮状病毒疫苗纳入免疫规划进行经济学评价，并探讨其成本效果。方法通过构建决策树Markov模型，模拟2012年中国出生的新生儿分别在不接种轮状病毒疫苗及接种Rotarix疫苗或Rotateq疫苗3种方案下的成本和健康结局，基于各方案间的增量成本效果比（ICER）与中国2012年人均国内生产总值（GDP）的比较确定最优方案。结果与不接种方案相比，Rotarix疫苗和R
通过归纳乳糖不耐受国内外研究进展，系统回顾乳糖不耐受的流行现状、发病机制以及乳糖酶缺乏的基因多态性、诊断方法和治疗等，总结出目前我国乳糖不耐受研究尚缺乏大范围流行病学调查证据，人群相关突变基因尚不明确，且缺乏简便有效的诊断方法，应深入进行乳糖不耐受的早期预防和干预研究。
目的了解2014-2015年杭州地区急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学特征。方法收集1 109份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便样本，采用一步法双重荧光RT-PCR对样本中诺如病毒（GⅠ、GⅡ型）进行初筛，然后随机选择诺如病毒阳性的样本核酸进行多重RT-PCR扩增，对产物进行测序分析。结果1 109份的粪便样本中，诺如病毒检出率为26.87% （298/1 109），以GⅡ亚型为主，占25.
目的比较研究克罗诺杆菌分离株的分种方法，探讨其中准确、快速有效分种方法。方法采用生化实验和对基因16S rRNA，fusA序列聚类分析的方法。结果105株菌的4项生化结果呈现6种情况，但无法将C. turicensis和C. universalis两个种分开；基于16S rRNA基因分析分种结果将105株菌分为5组，无法将C. sakazakii和C. malonaticus这两个种的菌株有效地分
目的了解中国成年人群生存质量及其影响因素。方法纳入2010年中国慢性病及其危险因素监测所有调查对象共83 666名。应用问卷收集调查对象的年龄、性别、相关疾病患病情况等信息。并使用WHO生存质量测定简表（WHOQOL-BREF）测定其生存质量。采用t检验和方差分析比较不同组间各维度得分的差异。运用基于多阶段复杂抽样设计的多元线性回归模型，分析生存质量的影响因素。结果中国成年人生理、心理、社会关系和
目的了解小学生家长对其子女精神暴力行为的发生情况，并探讨精神暴力行为的影响因素。方法对中国东北地区某城市2所小学1 164名1~ 6年级小学生家长采用自填式不记名问卷调查，了解其在最近3个月内对子女施加精神暴力状况，利用logistic回归方法分析相关影响因素。结果1 164名小学生家长中有78.1%报告在最近3个月内曾对子女施加过精神暴力。父母对男童施加精神暴力的比例明显高于对女童（81.3%
目的探讨孕中期和孕晚期妊娠期肝内胆汁淤积症（ICP）对分娩结局的影响。方法在马鞍山市优生优育队列（MABC）中，将孕周≤14周、符合入组标准的孕妇共3 474人纳入队列，在首次产检时收集孕妇的一般人口学信息，并收集孕中期和孕晚期血清总胆汁酸（TBA）的检测结果，符合临床诊断的作为病例，采用logistic回归分析孕中期和孕晚期ICP对分娩结局的影响。结果最终分析的样本人数为2 978人，ICP发生