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目的检测手足口病肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CoxAl6），探讨其所致普通病例临床特征差异。方法手足口病普通患儿咽拭子样本250例，采用实时荧光定量-聚合酶链反应（RT-PCR）对样本进行EV71和CoxAl6特异性核酸检测，根据病原学结果将普通病例分为EV71组和CoxAl6组，比较两组患儿的热程及主实验室指标。结果250例患儿样本中，EV71核酸阳性28．00％（70／250）。CoxAl6核酸阳性28．80％（72／250），两组比较差异无统计学意义（P〉0．05），EV71组