论文部分内容阅读
WRKY转录因子是植物所特有的一个超级基因家族,能调控植物生长发育过程及逆境反应.根据转录组测序获得的EST序列设计引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆了甘蓝型油菜WRKY30基因eDNA全长序列,并运用生物信息学手段对序列进行了分析及预测.结果 表明:BnaWRKY30-like基因全长cDNA序列中包含102 bp的5'-UTR序列,188 bp的3'-UTR序列以及942 bp的完整ORF,编码313个氨基酸.该转录因子蛋白相对分子量为35 319.85D,等电点为6.22,基本氨基酸中含量最高的丝氨酸(Ser),313个氨基酸中含有41个酸性氨基酸,34个碱性氨基酸,在121～182区域含有一个典型的WRKY结构域.亚细胞定位预测发现该转录因子定位于细胞核的可能性最高.蛋白质的二级结构预测表明共有α-螺旋占26.20％,延伸链占10.54％,β-转角占4.47％,无规则卷曲占58.79％.Bna WRKY3 0-like基因编码的蛋白具有典型的WRKY转录因子特征,与拟南芥WRKY30基因亲缘关系近,可能在油菜早期生长发育过程及盐胁迫中的发挥调控作用.