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本文清晰界定了刑事犯罪案件与行政违法案件的差别，根据《畜牧法》、《农产品质量安全法》、《食品安全法》、《动物防疫法》等法律法规规定，参照《刑法》及其相关司法解释，对畜牧兽医行政执法移送的涉嫌犯罪案件简要归纳为非法经营案，传染病菌种、毒种扩散案，重大环境污染事故案，生产、销售不符合卫生标准的食品案等，参照非法经营案立案追诉标准，传染病菌种、毒种扩散案立案追诉标准，重大环境污染事故案立案追诉标准，生产，销售不符合卫生标准的食品案立案追诉标准，生产销售有毒、有害食品案立案追诉标准等，畜牧兽医行政执法对涉嫌构成刑事犯罪的案件应当按照《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》及时移送司法机关。