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采用AFLP分子标记技术对54份甘蔗种质(14份祖亲种、40份栽培品种或品系)的遗传基础进行了分析。利用筛选出的4对多态性较强的引物组合(M+CAG/E+ACG,M+CTC/E+ACT,M+CTG/E+ACC,M+CTG/E+ACG),构建了甘蔗54份种质的AFLP指纹图谱,这4对引物组合共扩增出396条谱带,其中多态带390条,占98.5%。54份种质的遗传相似系数变化范围在0.281~0.943,平均0.708。聚类分析表明,随着相似系数结合线的不同,可分别将参试的甘蔗种质从属间(甘蔗属与斑茅种)、野