利用DEA-Malmquist模型考察了我国30个省(市、区)1994—2012年的低碳农业发展水平,并对其空间差异进行了比较分析。在此基础上,运用Tobit模型考察了影响其变化的主要机理。研究结果表明:(1)我国东、中部地区的一些省份低碳农业发展水平相对较高,而西部地区的省份则普遍偏低;结合30个地区低碳农业发展水平的数值差异,可将其划分为高速、快速、中速、慢速和下降等5个组别。(2)在推进低碳农业发展上,农业前沿技术发挥了更为重要的作用,而技术效率改善所起到的作用相对较小,对技术效率分解可知,规模效率对低碳农业发展的贡献程度要高于纯技术效率。(3)在惠农型"中央一号"文件全面出台之前,我国低碳农业发展主要受农村基础教育水平、经济发展水平、自然灾害等因素影响;而在此之后,则主要受农业公共投资、农业开放度、自然灾害等因素影响。分区域来看,无论是同一阶段还是不同阶段,影响我国东部、中部和西部地区低碳农业发展的因素都同中有异。