本文主要研究了公共服务平台下虚拟联盟成员选择和联盟企业间协同生产的联合优化问题。该问题主要涉及到虚拟联盟战略层面和运营层面两个层面,旨在实现虚拟联盟成员选择、订单分配和生产排序等三个阶段的协同优化。在分析单一联盟企业的生产排序最优化性质的基础上,本文给出了涉及到顾客订单分配和联盟成员选择的结构化性质。考虑到联合优化问题的复杂性,引入并拓展了用于求解连续优化问题的树种算法,开发了嵌入二维离散编码策略和离散种子生成规则的离散树种算法,给出了结合前述结构化性质的适应度计算方法,并开展了一系列仿真对比试验,实验结果表明所提算法相较于离散萤火虫算法和集合蛙跳算法等离散智能优化算法而言,在求解质量和鲁棒性上具有一定的优越性。本文的主要创新点在于提出了横跨战略层面和运营层面的虚拟联盟协同模型,开发了新颖的离散树种算法,能够为虚拟制造联盟的组建和运行提供一定的指导意义。