猪流行性腹泻病毒S基因和ORF3基因的扩增及遗传进化分析

来源 :农家科技(上旬刊) | 被引量 : 0次 | 上传用户:kaka88899999
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为进一步研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)在江苏省的现状,我们利用RT-PCR方法,对2018年5月下旬到2019年12月下旬采集的28份具有拉稀症状的幼猪小肠组织进行检测,结果显示只有一份样品的猪流行性腹泻病毒检测显示为阳性;分别针对S基因和ORF3序列设计不同的引物,随后对它们进行序列扩增、测定,并研究其遗传进化情况。通过实验我们发现,XJ-2018-China的S基因与其他10个不同毒株的核苷酸序列之间存在同源性,遗传进化树显示其与GenBank中登录号为KR153326序列的亲缘性为100%,而与疫苗株CV777的亲缘性较远;ORF3基因与其他10个不同的毒株的核苷酸序列也存在同源性,与GenBank中登录号为MK032692、MK071639、MH006965、KU252649、KR153326、KF804028、KF468753序列的亲缘性较近,而与疫苗株CV777的亲缘性较远。这些发现都为PEDV的科学防控提供一定的参考依据。
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