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女性阴道内寄生着多种微生物,鉴定阴道中存在的微生物有助于了解其在健康和疾病时的作用,但是许多微生物难以通过培养将其分离鉴定。近年来,一系列分子生物学的方法,如基于16SrRNA基因聚合酶链反应扩增法等用于研究阴道微生态并取得了较大的进展。利用分子生物学的非培养法检测女性阴道微生物发现,不论在健康女性还是细菌性阴道病（BV）患者中惰性乳杆菌是普遍存在的乳杆菌;还发现许多新的厌氧菌与BV高度相关,如阴道阿托波菌、阴道加德纳菌、BVAB1等。