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根据已报道的番茄花叶病毒Ｌ株系序列人工合成引物，经ＲＴ－ＰＣＲ扩增并克隆了我国番茄花叶病毒分离物的外壳蛋白ＣＰ基因及３‘端非编码我。序列测量结果表明，所得ｃＤＮＡ共长６８２个核苷酸，其中ＣＰ基因含４８０个核苷酸，编码１５８个氨基酸，３’端非编码区含２０２个核苷酸，其核苷酸序列与ＴｏＭＶ－Ｌ株系具有９９．５％的同源率。