美洲狼尾草survey测序及其gSSR分子标记的开发应用

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美洲狼尾草(Pennisetum glaucum)是重要的能源草和牧草,但其基因资源相对匮乏。为丰富基因组资源,本研究对美洲狼尾草进行survey测序明确其基因组特征,并开发gSSR标记。结果表明,美洲狼尾草的基因组大小为1.98 GB,重复序列比率为73.75%,杂合度为1.18%。同时,利用MISA软件,开发了37 738对SSR引物,并随机选择28对进行验证,均获得清晰的扩增产物,且其中18对(64.3%)引物显示出了多态性。最后利用这18对引物对40个材料进行了遗传多样性分析,发现美洲狼尾草种质资源遗传多样性丰富,种质资源可以聚类成为5类。研究结果可为狼尾草分子育种研究提供重要的基因资源。
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