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随着蛋白质组学技术的发展，蛋白质组学在生命科学研究中起到了举足轻重的作用。介绍了蛋白质组学研究的主要技术（双向电泳技术、电喷雾质谱技术、基质辅助激光解吸附质谱技术、四级杆一线性离子阱质谱技术），综述了各技术的优缺点，及其在经济贝类研究中的应用，并对贝类蛋白质组学研究存在的一些问题进行了探讨和展望。