【摘 要】
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目的 利用生物信息学方法分析前列腺癌基因表达谱芯片及测序数据,筛选前列腺癌差异表达基因及其转移相关的基因。方法 前列腺癌转移相关数据取自基因芯片公共数据库(GSE6919)
【机 构】
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中山火炬开发区医院泌尿外科,中山大学附属第三医院泌尿外科
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目的 利用生物信息学方法分析前列腺癌基因表达谱芯片及测序数据,筛选前列腺癌差异表达基因及其转移相关的基因。方法 前列腺癌转移相关数据取自基因芯片公共数据库(GSE6919),前列腺癌及正常组织数据取自癌症基因组图谱数据库(TCGA)。利用R语言、SRTING、Cytoscape等软件对两个数据集进行组间差异分析、基因模块聚类分析和富集分析等。结果 TCGA数据集中差异基因共3 336个(上调1 161个,下调2 175个),GSE6919数据集中差异表达基因共758个(上调370个,下调388个),取交集
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