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目的:基于RNA-Seq研究江西传统特色豆豉与肠上皮细胞的相互作用。方法:Caco-2细胞与豆豉水提样共孵育后,采用RNA-Seq筛选差异表达基因,进行KEGG、GO和PPI网络分析。结果:筛选差异表达基因17892个,其中显著性240个,含上调表达125个、下调表达115个。KEGG功能注释215个信号通路,主要富集在新陈代谢、免疫系统、细胞调控、细胞粘附等类别。GO分析主要涉及免疫应答、细胞结构及功能调控、营养素代谢、神经传导及激素分泌调节等生物学过程。PPI网络分析在STRING数据库内有效注释的2